Interested Article - Гаплогруппа D (Y-ДНК)

jan
  • 2021-05-14
  • 2

Гаплогруппа D (CTS3946) — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Как гаплогруппа D, так и E содержат однонуклеотидный полиморфизм , который имеется во всех гаплогруппах, кроме A и B (см. группа CT ), а также полиморфизм уникального события YAP, уникальный для гаплогруппы DE — общего предка D и Е.

Происхождение

Гаплогруппа D происходит от мутации Y-хромосомной гаплогруппы DE , произошедшей у мужчины, жившего предположительно 65,2 тыс. лет назад. Время жизни общего предка всех живущих носителей Y-хромосомной гаплогруппы D — 46,5 тыс. лет назад (даты определены по снипам компанией YFull ).

Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что гаплогруппа D образовалась в Африке около 73 тыс. л. н., а около 71 тыс. лет назад отделилась западноафриканская линия D0 . И гаплогруппа D, и гаплогруппа E содержат характеристику уникальный полиморфизм событий YAP, но показывают общее происхождение. Субклад гаплогруппы D1- M174 возник, с большой вероятностью в Азии, около 60 тыс. лет назад. Субклад гаплогруппы D1- M174 не встречается за пределами Азии. Гаплогруппа D2 была обнаружена незначительно в Африке и Передней Азии .

По мнению , гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет назад .

Палеогенетика

  • Гаплогруппа D обнаружена у образца Ma91 (ок. 4319 л. н.) из Малайзии .
  • Субклад D1a2b1 (D1b2a-CTS220 в ISOGG 2018) выявлен у представителя культуры Дзёмон , жившего примерно 3500—3800 лет назад . У образца I6341 (Burial 5, JOM_137, 1500—1000 лет до н. э., Funadomari, Ребун) определена Y-хромосомная гаплогруппа D-M174/F1344>D1b-M64.1>Z1516, у образца I13887 (1063 Burial 7, 2191—1982 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1a2a3a-Z1570 (D1b1c1 в ISOGG 2018), у образца I13886 (1062 Burial 6, 2136—1959 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1a2a3a-Z1575 (D1b1c1 в ISOGG 2018), у образца I13883 (1050 Burial 2, 984—835 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1b-M64.1>D1b1c-CTS6609>D1b1c1-Z1574>Y11739 (ISOGG 2018) .
  • Гаплогруппа D1a2a1 определена у представителя кобанской культуры из могильника Заюково-3, расположенного близ села Заюково в Баксанском районе Кабардино-Балкарии (VIII—VII века до н. э.) .
  • D1b-M64.1>Z1516>CTS220 определили у образца I15926 (SRM 3826-1163, Pogrebeniye 2, Burial #2, 1800—1950 гг.) со стоянки Nevelsk 2 на Сахалине .

Обзор

В настоящее время встречается с высокой частотой среди населения Тибета , Японского архипелага и Андаманских островов , однако, в силу неизвестных обстоятельств, пока не обнаружена на полуострове Индостан . Айны в Японии, а также народы джарава и онге на Андаманских островах имеют почти исключительно данную гаплогруппу, хотя у айнов кроме гаплогруппы D1a2 (81,3% ) с частотой около 15 % также встречается Y-хромосомная гаплогруппа C3 .

Также Y-хромосомная гаплогруппа D обнаружена с низкой или умеренной частотой у народов Центральной Азии и севера Восточной Азии, а также у китайцев-хань и народов мяо-яо в Китае и некоторых национальных меньшинств китайских провинций Сычуань и Юньнань , говорящих на тибето-бирманских языках и проживающих в непосредственной близости от тибетцев. Субклад D1a1a-M15, выявленный в популяции народа И ( Ляншань-Ийский автономный округ ) был разветвлением расширения тибетских групп с запада на восток на плато .

В отличие от гаплогруппы C , гаплогруппа D не мигрировала из Азии через Берингию в Новый Свет .

Гаплогруппа D также примечательна своей исключительной географической дифференциацией, когда определённый подкласс гаплогруппы чётко локализуется в какой-либо популяции, где большой процент лиц имеют гаплогруппу D:

Такая, по-видимому, древняя диверсификация гаплогруппы D заставляет предположить, что её скорее следует охарактеризовать как «супергаплогруппу», «макрогаплогруппу».

Особо характерными являются примеры гаплогруппы D у населения Японских островов, поскольку они содержат комплекс из как минимум пяти отдельных мутаций, свойственных гаплогруппе D, что ясно отличает их от гаплогруппы D, обнаруженной у жителей Тибета и Андаманских островов. Этот факт является свидетельством того, что гаплогруппа D1a2 была модальной гаплогруппой доисторической культуры Дзёмон на Японских островах.

Подклассы

Филогенетическое дерево

ISOGG (version: 14.151) .

Примечания

  1. ↑ Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. (англ.) // Genetics : journal. — 2019. — 13 June. — P. genetics.302368.2019 . — ISSN . — doi : . — .
  2. . Дата обращения: 30 марта 2018. 31 августа 2019 года.
  3. ↑ Estes, Roberta (англ.) . DNAeXplained - Genetic Genealogy (21 июня 2019). Дата обращения: 8 июля 2019. 6 июля 2019 года.
  4. Shi et al. (2008) от 31 марта 2010 на Wayback Machine , BMC Biology
  5. Tatiana M. Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  6. Hugh McColl et al. , 2018
  7. POB-162 Phenotype and phylogeny of Neolithic Japanese hunter-gatherers, Jomon people, based on whole nuclear genome sequences // от 7 июля 2018 на Wayback Machine
  8. ↑ Chuan-Chao Wang et al. от 31 июля 2021 на Wayback Machine (Supplementary Tables // Table 1. Newly reported ancient individuals), 2021
  9. Eugenia Boulygina et al. , 2020
  10. Michael F. Hammer, Tatiana M. Karafet, Hwayong Park, Keiichi Omoto, Shinji Harihara, Mark Stoneking and Satoshi Horai, «Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes», Journal of Human Genetics Volume 51, Number 1 / January, 2006.
  11. Yusuke Watanabe, Izumi Naka, Seik-Soon Khor, Hiromi Sawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Jun Ohashi от 30 сентября 2019 на Wayback Machine , 2019
  12. Fei Wang, Feng Song, Mengyuan Song, Jienan Li, Mingkun Xie, Yiping Hou . от 16 июля 2021 на Wayback Machine , 28 April 2021
  13. . Дата обращения: 6 сентября 2019. 11 октября 2019 года.
  14. ↑ Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID .
  15. . www.yfull.com . Дата обращения: 3 сентября 2019. 31 августа 2019 года.
  16. . Дата обращения: 11 сентября 2017. 28 мая 2017 года.

Литература

  • Shi; et al. (2008), (PDF) , BMC Biology , 6 (45), doi : {{ citation }} : Явное указание et al. в: |author= ( справка ) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) ( ссылка )

См. также

п • о • р Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
A0-T
A00 A0 A1
A1a
A1b1 BT
B CT
DE CF
E C F
F1  F2  F3
G
H IJK
IJ K
I J K2
L (K1a) T (K1b) K2a/K2a1/ NO /NO1
N O P (K2b2) /P1
S (K2b1a) M (K2b1b) Q R

Ссылки

Источник —

jan
  • 2021-05-14
  • 2
  • Tags:

Same as Гаплогруппа D (Y-ДНК)

The title for the last searches