Гаплотип (сокр. от « гаплоидный генотип ») — совокупность аллелей на локусах одной хромосомы , обычно наследуемых вместе. Если же при кроссинговере комбинация аллелей меняется (что происходит очень редко), говорят о возникновении нового гаплотипа. Гаплотип может быть как у одного локуса, так и у целого генома . Генотип определенных генов диплоидной особи состоит из двух гаплотипов, расположенных на двух хромосомах, полученных от матери и отца соответственно.

В генетической генеалогии гаплотипом также называют результат исследования STR -маркеров на нескольких локусах Y-хромосомы, при этом количество повторов называется аллелем.

Генотип и гаплотип

Не всегда возможно определить гаплотип особи по её генотипу. Рассмотрим, например, диплоидный организм и два локуса (на одной хромосоме) каждый из которых имеет два возможных аллеля. Первый локус имеет аллели A и T , что даёт 3 возможных генотипа AA , TT и AT . Второй локус имеет аллели C и G (генотипы CC , GG , CG ). Таким образом для отдельно взятой особи существует 9 возможных гаплотипов по этой паре локусов.

Как видно из таблицы, для организма, гомозиготного только по одному локусу, существует единственная комбинация гаплотипов (например, для генотипа AA GC соответствующими гаплотипами являются AG и AC ). Если же особь гетерозиготна по обоим локусам, то возможны две комбинации гаплотипов. Точное определение гаплотипа обеспечивается только секвенированием . Однако существуют алгоритмы, позволяющие оценить вероятность определённого гаплотипа в случае подобной неопределённости.

См. также

• Гаплогруппы
• Генетическая генеалогия

В статье не хватает ссылок на источники (см. рекомендации по поиску ). Информация должна быть проверяема , иначе она может быть удалена. Вы можете статью, добавив ссылки на авторитетные источники в виде сносок . ( 7 июня 2019 )