В 1474 году она вышла замуж за
Филиппа
(1448—1508), который впоследствии стал курфюрстом Пфальца. Великолепная свадебная церемония прошла в
Амберге
и стала известна как «Амбергская свадьба». Ранее Филипп отказался жениться на
Марии Бургундской
и Анне, наследнице графства
Катценельнбоген
. На свадьбе присутствовало более тысячи гостей, в том числе и четырнадцать правящих принцев. Стол ломился от яств; было випито 110 тысяч литров вина
и съедено 10 тысяч цыплят
.
Через два года после свадьбы Филипп стал курфюрстом Пфальца. В 1482 году Маргарита покинула
Гейдельберг
, спасаясь от чумы, и отправилась в замок Винцинген, где родила своего четвёртого сына
Фридриха
, который впоследствии стал курфюрстом Фридрихом II
.
Благодаря своей жене, у Филиппа были хорошие отношения с её братом, герцогом
Георгом
Богатым
; их дети женились в 1499 году. Династический брак стал началом политического и военного союза между Баварией-Ландсхутом и Пфальцем
. Георг, у которого не было наследника мужского пола, завещал свои владения своему зятю и племяннику.
Дети
21 февраля 1474 Маргарита вышла замуж за
Филиппа Пфальцского
. У них было четырнадцать детей: