Эдуардо Эрнекян родился в семье армянских эмигрантов. Семья Эрнекянов основала текстильное предприятие. Эрнекян никогда не был женат и не имеет детей. С ним работают Мартин и Уго Эрнекяны, сыновья его умершего брата Альберто. Состояние Эрнекяна в 2013 году оценивается в 1,8 млрд долларов США. В списке самых богатых людей Аргентины 88-летний предприниматель находится на 2-м месте. На данный момент Эрнекян в той или иной степени контролирует 49 аэропортов мира (Аргентина, Италия, Армения, Эквадор, Перу, Бразилия и Уругвай) и имеет более 1000 квадратных километров земли
.
Наиболее известными предприятиями Эрнекяна являются
и
.