Термин эпигенетическое наследование имеет два близких по смыслу значения:

• Изучение процессов, вовлеченных в развитие организма, например, инактивацию X-хромосомы у самок млекопитающих и выключение генов
• Изучение наследуемых изменений в функционировании генов, которые происходят без изменений последовательности нуклеотидов ДНК. Это включает, например, влияние факторов внешней среды на экспрессию генов у потомков.