Ана-телофазный анализ
— генетический тест, основанный на визуальном учёте
хромосомных аберраций (повреждения хромосом)
на стадии
анафазы
и
телофазы
митотического цикла клетки
. Ана- телофазный анализ — простой, экономичный метод, который не требует знания кариотипа и идентификации хромосом. Он позволяет выявить лишь определенные типы
хромосомных аберраций
, но его чувствительность вполне достаточна для заключения «
мутагенен
» или «
не мутагенен
» фактор. Ана- телофазный анализ является достаточно чувствительным, корректным и удобным на первом этапе экотоксикогенетического исследования
.
Содержание
История
Выбросы генотоксикантов в окружающую среду в результате антропогенной активности людей порождают необходимость в подходящих генетических тестах, чтобы оценить потенциальное воздействие данных факторов на экосистемы. Ана- телофазный анализ был описан как экспрессный и экономичный генетический тест. Среди наиболее ранних исследований, в которых данный анализ был применен, следует отметить эксперименты на луке (
A. Levan
). До настоящего времени применяется как основной метод генетического анализа для растительной тест-системы
Allium test
, в которой исследуется влияние различных генотоксикантов на клетки корневых меристем
.
Чувствительность и применимость
Ана-телофазный анализ высокочувствителен при тестах самой разной направленности. Будь то пробы субстратов из окружающей среды (
вода
,
почва
,
донные отложения
) или же вещества антропогенного происхождения, а также излучения различного спектра (как ионизирующие, так и неионизирующие). Кроме того достоинством данного анализа является его универсальность (он применим практически во всех случаях, когда идёт
митоз
) и простота в приготовлении препаратов, что очень важно при работе с
клетками
животных
. Ана-телофазный анализ
хромосомных аберраций
на клетках лука (
Allium cepa
), рекомендован как инструмент цитомониторинга окружающей среды. Путём измерения генотоксичности, он способствует оценке степени экологического риска от средств бытового и промышленного назначения, постоянно внедряемых и становящихся все более важными в повседневной жизни
.
Техника проведения анализа
Включает анализ под микроскопом препарата клеток, зафиксированных и окрашенных на стадии
пролиферации
. Существует ряд вариаций ана- телофазного анализа. Так, согласно оригинальному варианту анализа, описанному Fiskesjo (
1985
г.) на препарате подсчитываются первые 100
анафазных
и
телофазных
клеток, из которых отмечаются
аберрантные
. Позднее стал применяться иной вариант И. М. Прохорова и соавт. (2003), который учитывает все
анафазы
и
телофазы
на препарате, среди которых отмечаются
аберрантные
. Пригодными для учёта
хромосомных аберраций
являются не очень ранние
анафазы
и ранние
телофазы
. Поскольку
делящаяся клетка
не всегда распластывается на препарате по продольной оси деления, то при отборе клеток, пригодных для подсчета хромосомных аберраций, надо принимать во внимание расстояние между дочерними
ядрами
— оно должно быть не меньше размера одного из них
.
Типы анализируемых аберраций
На стадии
анафазы
и
телофазы
подсчитываются две классические для данного анализа категории аберраций, представляющие собой отставший от полюсов хромосомный материал (ацентрические фрагменты и кольца, отставшие хромосомы) и мосты. Все они достаточно хорошо видны визуально и различимы. Очень часто в отдельную категорию включаются и подсчитываются отставания и забегания, указывающие на изменения ахроматинового веретена деления.
Ацентрические фрагменты и кольца могут быть одиночными и парными. Они располагаются между дочерними звёздами или в стороне от них. Основная задача сводится к распознаванию одиночности или парности и к отличию их от отставших хромосом. Одиночные фрагменты представляют собой фрагменты хроматидного происхождения. Потеря одного фрагмента из пары (хромосомного происхождения) — явление, очевидно, редкое, поскольку притяжение между сестринскими хроматидами сохраняется и на стадии анафазы. По этой же причине маловероятно предположение, что одиночный фрагмент может происходить за счет слияния сестринских хроматид парного фрагмента и развёртывания их по длине.
Парные фрагменты — это фрагменты изохроматидного или хромосомного происхождения. О соединении повреждённых концов сестринских хроматид, а не об отставшей хромосоме можно говорить только при условии, если парный фрагмент имеет дугообразный вид. Следует отметить, что оценка этого признака крайне затруднительна и поэтому не может проводиться во всех случаях.
Мосты иногда разделяют на хромосомные и хроматидные. Под хромосомным мостом понимают дицентричческую хромосому: он состоит из двух хроматид, чаще всего перекрещённых. Хроматидный мост — дицентрическая хроматида, поэтому он виден как одиночный. По «толщине» моста нельзя судить о его хромосомном или хроматидном характере. Не всегда можно дифференцировать зарактер моста и поэтому вряд ли целесообразно проводить такое разделение при использовании тотального метода окрашивания хромосом, не позволяющего идентифицировать отдельные хроматиды.
Отставшие хромосомы или хроматиды чаще всего распознаются легко, так как в них можно видеть центромеру либо неоднородность структуры, что нехарактерно для фрагментов. Наибольшие трудности возникают при необходимости отличить отставшую метацентрическую хроматиду от акроцентрической хромосомы. Вместе с тем ответ на этот вопрос важен, потому что в результате отставания хромосомы образуются две гипоплоидные клетки, а в результате отставания хроматиды одна гипоплоидная и одна нормальная клетка.
Абсолютного стандарта для учёта аберраций и для представления полученных результатов быть не может. На практике встречаются сочетания разных типов аберраций в одной и той же клетке. Теоретически можно ожидать любые сочетания аберраций. Основой этого является асинхронность редупликации наследственного материала. Кроме того попутно другие, реже встречающиеся типы аберраций, такие как мультиполярные митозы и полиплоидии, так же могут регистрироваться
.
ХА+отс., %
— частота хромосомных аберраций и отставаний
Частота хромосомных аберраций и отставаний
— рассчитывается как отношение суммы
ана
- и
телофазных
клеток, в которых были зарегистрированы нарушения, к общему числу проанализированных ана-телефаз.
, где
XA+отс.
— сумма аберрантных клеток, находящихся на стадии
ана
- и
телофазы
, а
N(А+Т)
— общее число проанализированных анафаз и телофаз на препарате.
Преобразование
Частота хромосомных аберраций и отставаний может быть представлена в виде выраженности мутагенного эффекта, согласно системе интегральной оценки мутагенного эффекта.
Рекомендации по проведению ана- телофазного анализа
Для большинства исследований можно рекомендовать следующее:
Важным условием при оценке типов (спектра и частоты хромосомных аберраций) является проведение их учёта в первом после действия мутагена клеточном делении. Это связано с тем, что значительная часть аберраций и аберрантных клеток элиминируется уже после первого деления или приобретает другой вид, хотя некоторые хромосомные аберрации, которые наблюдаются в виде мостов, могут сохраняться в течение 12—15 митотических циклов.
Не проводить анализ перестроек при наложении клеток и при нарушении целостности их оболочки.
Принимать во внимание все типы морфологических изменений, учёт которых возможен при данной методике.
Анализировать изменения поклеточно, то есть регистрировать в протоколе опытов сочетаемость аберраций, встречающихся в каждой клетке.
Клетки, в которых не удается определить тип аберраций, нужно относить к классу клеток с неразобранными аберрациями; их подсчитывать только в подсчёте общего количества аберрантных клеток.
Быть крайне осторожным при объединениях любого рода (например, данных по отдельным повторностям и данных аналогичных опытов, по точечным фрагментам и кольцам, по дицентрикам и сопутствующим ацентрикам и т. д.). Если правомочность какого-то объединения доказана для некоторого объекта или условий, то для других объектов и условий она должна специально проверяться.
При представлении данных в статье необходимо указывать число обследованных особей (или повторностей опыта), число проанализированных клеток, число каждого из учитываемых типов аберраций, типы аберрантных клеток и их частоту, число анеуплоидных клеток.
Для точного определения необходимо знать структуру кариотипа изучаемого вида растений или животных в норме
.
↑
Прохорова И. М., Фомичёва П. Н., Ковалёва М. И.
Оценка митотоксического и мутагенного действия факторов окружающей среды // ЯрГУ : Методические указания. — Ярославль: ЯрГУ, 2003. —
С. 23,26
.
↑
Jette Rank.
The method of Allium anaphase–telophase chromosome aberration assay // Ekologija. — Vilnius, 2003. —
Т. 1
. —
С. 38-42
.
Levan Albert.
THE EFFECT OF COLCHICINE ON ROOT MITOSES IN ALLIUM // Hereditas. — 1938. —
Т. 24
,
вып. 4
. —
С. 471-486
.
Fiskesjо G.
// Hereditas. — 1985. —
Т. 102
. —
С. 99-112
.
W. Venegas, C. Lasne, R. Lowy, J.-P. Buisson and I. Chouroulinkov.
Naphthofurans induced chromosomal aberrations detected in metaphase, anaphase and telophase V79 Chinese hamster cells // Mutation Research/Genetic Toxicology. — Elsevier B.V., 1985. —
С. 53-62
.
↑
Калаев В.Н., Карпова С.С.
Цитогенетический мониторинг: методы оценки загрязнения окружающей среды и состояния генетического аппарата организма. — ВГУ, 2004. — 80 с.
Ссылки
Песня Д.С., Романовский А.В.
: Научно-практические пособие. — Москва: JRE – ИРЭ им. В.А.Котельникова РАН, 2010. —
С. 929
.