Interested Article - Сателлитная ДНК

ashanti
  • 2021-12-08
  • 1

Сателли́тная ДНК ( англ. Satellite DNA ) — характерный компонент эукариотического генома, состоящий из тандемно организованных повторов нуклеотидных последовательностей. Сателлитная ДНК не кодирует белки и локализована в конститутивном гетерохроматине хромосом . Сателлитная ДНК характерна для теломерных и центромерных областей хромосом .

Изначально термином «сателлитная ДНК» обозначали ту часть эукариотического генома , которая отделялась при градиентном ультрацентрифугировании и, следовательно, по плотности и по содержанию пар АТ/ГЦ должна была отличаться от основной массы ДНК. Этот термин является техническим обозначением физико-химических свойств означенных фракций, а не отражением их биологических свойств. В дальнейшем выяснилось, что гены рибосомной РНК , митохондриальные и хлоропластные ДНК могут образовывать отдельные сателлитоподобные пики в градиенте. С другой стороны, «истинные» сателлиты с ГЦ-составом, идентичным с основной ДНК, невозможно отделить от основной массы ДНК, и они обнаруживаются как «скрытые» сателлиты .

Следует четко разграничить термины «сателлитная ДНК» и минисателлитные и микросателлитные ДНК. Основное различие между ними заключается, во-первых, в том, что мини- и микросателлиты, в отличие от сателлитной ДНК, обнаруживаются в эухроматине , а во-вторых, число копий повторов в мини- и микросателлитах намного меньше по сравнению с сателлитной ДНК. Общим для всех трёх компонентов является наличие тандемно расположенных повторов, а префиксы «мини-» и «микро-» отражают различия в длине повторяющихся единиц. Длина повторяющейся единицы минисателлитных ДНК составляет 10—100 пар нуклеотидов , а микросателлитных — менее 10 пар . Длина повторяющегося мотива сателлитной ДНК не имеет каких-либо ограничений. Она варьирует от 2 до нескольких сотен пар .

Сателлитную ДНК не следует путать с сателлитными (спутничными) районами акроцентрических хромосом . Использование одного и того же термина является неудачным совпадением, сложившимся исторически .

История открытия и изучения

Открытие сателлитной ДНК связано с разработкой метода ультрацентрифугирования в градиенте плотности. В конце 1950-х — начале 1960-х этот метод был основным для фракционирования и характеристики тотальной ДНК. Первые опыты по центрифугированию ДНК в градиенте плотности хлорида цезия , проведённые на ДНК из тимуса теленка, показали гетерогенность её состава. Сам термин «сателлитная ДНК» был введён в 1961 году Солом Китом в результате опытов по центрифугированию ДНК макаки-резуса, аллигатора, морской свинки и домовой мыши . В ходе этих опытов было найдено, что кроме основного пика в распределении плотности есть минорный «сателлитный» пик. Однако природа этого типа ДНК оставалась неизвестной. Первые предположения о природе сателлитной ДНК были сделаны годом позже. Schildkraut с коллегами предположили, что минорный пик в распределении плотности ДНК может быть обусловлен наличием симботических организмов либо присутствием ДНК, обогащённых «неклассическими» нуклеотидными основаниями, например, 5-метилитозином .

Первым исследованным вопросом о природе сателлитной ДНК стал вопрос внутриклеточной локализации. Результаты опытов по сравнению профилей плавучей плотности ядерной ДНК и ДНК хлоропластов листьев шпината огородного ( Spinacia oleracea ) , а также ядерной ДНК и митохондриальной ДНК нейроспоры густой ( Neurospora crassa ) , дрожжей , животных показали, что плавучая плотность ДНК органелл выше, чем ядерной ДНК, что привело к выводу о том, что минорный пик «сателлитной ДНК» относится к ДНК органелл . Но работы двух следующих годов способствовали изменению этих взглядов. Была найдена гетерогенность профиля плавучей плотности непосредственно ядерной ДНК , а также что значительная (несколько десятков процентов) ядерной ДНК относится к «сателлитному» пику плавучей плотности . Дальнейшие опыты по центрифугированию с использованием градиентов сульфата цезия , ионов тяжелых металлов, антибиотиков позволили найти «скрытые» сателлиты, то есть показать, что сателлитная ДНК не является гомогенной и состоит из разных последовательностей .

Типы сателлитной ДНК

Сателлитная ДНК состоит из множественных тандемных повторов одной и той же последовательности, длина которой варьирует от одной нуклеотидной пары до нескольких тысяч пар нуклеотидов .

Некоторые типы сателлитной ДНК, обнаруженные у человека
Тип Размер повторяющегося фрагмента ( п.н. ) Местонахождение
α 171 Все хромосомы
β 68 Центромеры хромосом 1 , 9 , 13 , 14 , 15 , 21 , 22 и Y
Сателлит 1 25—48 Центромеры и другие области гетерохроматина большинства хромосом
Сателлит 2 5 Большинство хромосом
Сателлит 3 5 Большинство хромосом

Примечания

  1. ↑ Хемлебен В., Беридзе Т. Г., Бахман Л., Коварик Я., Торрес Р. // Успехи биологической химии. — 2003. — Т. 43 . — С. 267—306 . 18 мая 2015 года.
  2. Нуклеиновые кислоты: от А до Я / Б. Аппель [и др.]. — М. : Бином: Лаборатория знаний, 2013. — 413 с. — 700 экз. — ISBN 978-5-9963-0376-2 .
  3. Фогель Ф., Мотульски А. Генетика человека: В 3-х т. — М. : Мир, 1989. — Т. 1. — С. 116—117. — 312 с. — ISBN 5-03-000287-1 .
  4. Kit, S. Equilibrium sedimentation in density gradients of DNA preparations from animal tissues // Journal of molecular biology. — 1961. — Т. 3 , № 6 . — С. 711IN1—716IN2 .
  5. Schildkraut C. L., Marmur J., Doty P. Determination of the base composition of deoxyribonucleic acid from its buoyant density in CsCl // Journal of molecular biology. — 1962. — Т. 4 , № 6 . — С. 430—443 .
  6. Chun E. H., Vaughan M. H., Rich A. The isolation and characterization of DNA associated with chloroplast preparations // Journal of molecular biology. — 1963. — Т. 7 , № 2 . — С. 130—141 .
  7. Luck, D. J., & Reich, E. (1964). DNA in mitochondria of Neurospora crassa . Proceedings of the National Academy of Sciences, 52(4), 931—938.
  8. Tewari, K. K., Jayaraman, J., & Mahler, H. R. (1965). Separation and characterization of mitochondrial DNA from yeast. Biochemical and biophysical research communications, 21(2), 141—148.
  9. Rabinowitz, M., Sinclair, J., DeSalle, L., Haselkorn, R. , & Swift, H. H. (1965). Isolation of deoxyribonucleic acid from mitochondria of chick embryo heart and liver. Proceedings of the National Academy of Sciences, 53(5), 1126—1133.
  10. Borst, P., & Ruttenberg, G. J. C. M. (1966). Renaturation of mitochondrial DNA.Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Nucleic Acids and Protein Synthesis,114(3), 645—647.
  11. Corneo G, Moore C, Sanadi DR, Grossman L, Marmur J (1966) Mitochondrial DNA in yeast and some mammalian species. Science, 151, 687—689
  12. Beridze, T. G., Odintsova, M. S., & Sissakyan, N. M. (1967). Distribution of DNA components of bean leaves in the fractions of cell structures. Mol Biol (Mosc), 1, 142—153.
  13. Corneo, G., Ginelli, E., & Polli, E. (1971). Renaturation properties and localization in heterochromatin of human satellite DNA’s. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Nucleic Acids and Protein Synthesis, 247(4), 528—534.
  14. MeSH

Литература

Ссылки

  • (англ.) . Laboratory of Molecular Cytogenetics, Institute of Plant Molecular Biology, Ceske Budejovice, Czech Republic. Дата обращения: 11 мая 2013. 17 мая 2013 года.
Источник —

ashanti
  • 2021-12-08
  • 1
  • Tags:

Same as Сателлитная ДНК

The title for the last searches