Interested Article - Интеграза

Ядро интегразы
Идентификаторы
Символ rve
Pfam
Pfam clan
Доступные структуры белков
Pfam
PDB ; ;
ДНК-связывающий домен интегразы
Идентификаторы
Символ IN DBD C
Pfam
Доступные структуры белков
Pfam
PDB ; ;

Интеграза ( IN ) — фермент , катализирующий интеграцию (включение) ДНК вируса ( ретровируса , в частности, ВИЧ ) в хромосому клетки -хозяина. Перед интеграцией линейные молекулы ДНК вируса сначала замыкаются в кольцо и затем уже встраиваются.

Ретровирусные интегразы — ключевой компонент прединтеграционного комплекса ().

Сходные ферменты фагов — phage integrase , например λ phage integrase (Int).

Структура

Все ретровирусные интегразы состоят из трех канонических доменов:

  • N-концевой цинк-связывающий домен с мотивом HHCC (например, His12 His16 Cys40 Cys43 у ВИЧ-1);
  • каталитический домен (RNaseH);
  • C-концевой ДНК-связывающий домен (SH3).

Изучена структура доменов интеграз вирусов HIV-1, HIV-2, SIV, Rous Sarcoma Virus (RSV), первые результаты опубликованы в 1994 году. Имеются данные, свидетельствующие, что интеграза функционирует как тетрамер. Несколько белков клетки взаимодействуют с интегразой, в частности, человеческий хроматин-ассоциированный LEDGF.

Интеграза ВИЧ

Вирус иммунодефицита человека содержит интегразу размером 32 кДа в гене . Данный фермент является перспективной целью для ВААРТ . Используется 3 препарата, являющихся ингибиторами интегразы ВИЧ: Ралтегравир (RAL, Исентресс, с 2007 года), Долутегравир (DTG, Тивикай), Элвитегравир (EVG, с 2012 года)

Примечания

  1. (неопр.) . Дата обращения: 20 августа 2016. 15 ноября 2016 года.
  2. от 1 октября 2008 на Wayback Machine , Успехи биологической химии, т. 45, 2005, с. 87—122
  3. от 11 сентября 2016 на Wayback Machine / Adv Pharmacol. 2013;67:75-105. ISSN 1054-3589, doi:10.1016/B978-0-12-405880-4.00003-2 .

Ссылки

  • / Microbiol Spectr. 2014;2(6):1-22.
  • / J Biol Chem. 2012 Nov 30;287(49):40858-66. doi :
  • / The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 1996

Same as Интеграза