Предпочте́ние кодо́нов
— понятие, описывающее явление неравных частот встречаемости синонимичных
кодонов
в кодирующих областях
генома
.
В целом генетический код консервативен среди организмов. Однако предпочтение кодонов варьируется между организмами: в разных организмах выбор частых и редких синонимичных кодонов различен
. В то же время этот выбор более или менее постоянен в разных генах одного
генома
. Гипотеза о том, что различные организмы имеют различные предпочтения, получила название геномной гипотезы предпочтения кодонов
.
По мере накопления доступных для анализа нуклеотидных последовательностей из разных организмов становилось понятно, что неравное распределение синонимичных кодонов находится под действием
эволюционных
сил (
естественный отбор
,
дрейф генов
,
мутации
) и может проявляться по-разному в разных участках
генов
, геномов и в разных организмах.
Общий обзор
Вследствие вырожденности
генетического кода
часть
аминокислот
закодирована несколькими кодонами. Кодоны, кодирующие одну аминокислоту, называют синонимичными, или изоакцепторными. Для 18 аминокислот существует более одного кодона (от 2 до 6). Для восьми аминокислот третья позиция их кодонов является вырожденной — там может встречаться любой из четырёх возможных
нуклеотидов
. Длительное время считалось, что изоакцепторные кодоны равноправны, поскольку последовательность кодируемого белка не меняется, и
мутации
, превращающие один изоакцепторный кодон в другой (например, мутации по третьему положению четырёхкратно вырожденных кодонов), являются нейтральными («молчащими»). Однако с появлением в открытом доступе нуклеотидных последовательностей различных генов стали накапливаться свидетельства неравного распределения синонимичных кодонов в кодирующей
ДНК
. В англоязычной литературе это явление получило название Codon usage bias
.
Эволюционные механизмы
Существуют две гипотезы, объясняющие явление предпочтения кодонов
.
Мутационная (нейтральная) гипотеза
предполагает, что предпочтение кодонов существует из-за различных мутационных паттернов — некоторые кодоны в большей степени подвержены мутациям и поэтому встречаются реже.
Гипотеза отбора
объясняет существование кодонного предпочтения действием
естественного отбора
— предпочтение кодонов влияет на эффективность и точность
экспрессии генов
и, таким образом, создаётся и поддерживается отбором.
Мутационная гипотеза
Мутационная гипотеза основана на том, что мутационные паттерны различаются у разных организмов и в разных частях одного генома. В результате этого различные кодоны мутируют с различной частотой, что может быть причиной различных предпочтений кодонов. Например, одним из наиболее значимых параметров, объясняющих различные предпочтения кодонов в разных организмах, является
GC-состав
.
Гипотеза естественного отбора
Существуют доказательства и в пользу влияния
естественного отбора
. Мутационная гипотеза не может объяснить, почему наиболее частыми кодонами являются те, которые узнаются наиболее встречаемыми
тРНК
. Также, помимо GC-состава, предпочтение кодонов очень сильно коррелирует с уровнем экспрессии гена
. Часто функционально связанные гены, с большой вероятностью экспрессирующиеся на одном уровне, имеют одинаковые кодонные предпочтения. В принципе, уровень экспрессии гена может влиять на мутационные паттерны и, именно таким образом, на предпочтение кодонов
. Однако было показано, что предпочтения кодонов в
экзонах
и тринуклеотидов в
интронах
могут различаться, из чего следует, что кодонные предпочтения генов не могут быть объяснены только влиянием экспрессии на мутационный процесс (то есть может быть вовлечен и естественный отбор)
.
Модель баланса действующих сил
Точные причины выбора предпочтительных кодонов остаются неясными. Однако, учитывая существование свидетельств в пользу и естественного отбора, и мутационного процесса, была сформирована модель предпочтения мажорных кодонов, или модель баланса мутационного процесса, естественного отбора и
генетического дрейфа
. В рамках этой модели естественный отбор поддерживает некоторые кодоны (предпочтительные, или мажорные) на более высоких частотах, в то время как мутационный процесс и генетический дрейф позволяют существовать минорным кодонам. Уровень экспрессии, функциональные связи, скорость
рекомбинации
и другие факторы могут обеспечивать разную степень выраженности предпочтения кодонов в разных генах
.
Модель предпочтения мажорных кодонов пытались проверить количественно. Поначалу существование и направление естественного отбора и мутационного процесса пытались оценить для разных видов
Drosophila
. Результаты несколько менялись с появлением новых данных, однако в целом было показано, что в разных генах обычно либо наблюдается слабый положительный отбор в пользу мажорных кодонов, либо отбор не наблюдается. Это в общем не противоречит модели предпочтения мажорных кодонов и тому факту, что в разных генах степень выраженности предпочтения кодонов различается. Однако для некоторых генов был показан слабый положительный отбор в пользу минорных кодонов, что свидетельствует о том, что естественный отбор не всегда поддерживает кодоны, обеспечивающие эффективность и точность экспрессии
.
Биологические эффекты
Кодонные предпочтения можно рассматривать на разных уровнях: на уровне различных
видов
, внутри одного генома и в пределах одного гена.
Видовой уровень
На данном уровне кодонные предпочтения в значительной мере определяются GC-составом генома. Показано, что по одним лишь некодирующим областям можно довольно точно предсказать различия в кодонных предпочтениях разных видов
бактерий
. Для
млекопитающих
, чья скорость мутаций в большой степени определяется контекстом (в частности, CpG динуклеотидами), показана зависимость паттерна предпочтения кодонов от контекста последовательности
.
Таким образом, видовые различия кодонных предпочтений объясняются преимущественно мутационными процессами
.
Геномный уровень
Степень выраженности кодонного предпочтения варьируется среди различных генов в геноме. Общими закономерностями, продемонстрированными на многих
модельных организмах
, являются положительная корреляция между уровнем экспрессии и силой кодонного предпочтения (степень выраженности неравных частот кодонов) и отрицательная корреляция между уровнем экспрессии и скоростью синонимичных замен
. Классическим объяснением данных закономерностей является действие естественного отбора: в генах с высоким уровнем экспрессии предпочтение кодонов сильно выражено и хорошо согласуется с паттерном встречаемости изоакцепторных тРНК в
клетке
. Это объяснение не охватывает всех полученных на данных момент сведений: около трети бактериальных геномов не содержат доказательства подобного отбора на уровне
трансляции
. Кроме того, остаётся неясной причина трансляционного отбора: предпочтение кодонов в высоко экспрессируемых генах может быть обусловлено как эффективностью, так и точностью трансляции. Обе модели имеют экспериментальные подтверждения:
-
связь
точности трансляции
и кодонного предпочтения показана для
D. melanogaster
,
C. elegans
и некоторых
одноклеточных
. Для этих видов установлено, что
высококонсервативные
аминокислотные
остатки
имеют более выраженную адаптацию кодонного состава к уровню изоакцепторных тРНК. Для
кишечной палочки
показана
корреляция между степенью кодонной адаптации и длиной белка: поскольку ошибки трансляции энергетически невыгодны, цена ошибки увеличивается с длиной белка. Эта корреляция, однако, не наблюдается у ряда
многоклеточных
модельных организмов
;
-
в пользу важности
эффективности трансляции
говорит корреляция между минимальным временем жизни поколения бактериальных видов и степенью кодонной адаптации в высоко экспрессируемых генах
. В этом случае логично ожидать корреляцию, если адаптация повышает скорость элонгации белковой цепи, но не точность трансляции.
В принципе, эти две модели не противоречат друг другу. Но для некоторых аминокислот показано, что скорость элонгации и точность трансляции имеют различные оптимальные кодоны
.
Уровень одного гена
В генах есть определённые
мотивы
(сайты посадки различных
факторов
, сайты
сплайсинга
и т. д.), нарушение которых может привести к серьёзным последствиям. В этих мотивах даже синонимические замены находятся под отбором. Так, например, показано, что вблизи сайтов сплайсинга паттерн кодонного предпочтения отличается от паттерна по гену в целом и может не совпадать с трансляционно оптимальным паттерном
. Особые паттерны минорных кодонов могут возникать в местах остановки
рибосомы
, необходимых для правильного сопряжённого с трансляцией
фолдинга
.
Помимо этих мотивов можно выделить некоторые общие закономерности, задающие вариацию кодонного предпочтения в пределах одного гена:
-
образование
третичной структуры
на 5'-конце
мРНК
подавляет инициацию трансляции. Для широкого спектра организмов показано, что в 5'-регионе мРНК снижены кодонная адаптация и частота синонимичных замен
;
-
обнаружена слабая адаптация кодонов в пределах первых 90—150
нуклеотидов
гена. Предложено несколько объяснений данному наблюдению. Возможно, регуляторное замедление начальных этапов элонгации препятствует столкновению рибосом на 3'-конце мРНК
. Другое возможное преимущество — упрощение посадки
шаперонов
на
синтезируемый
полипептид
;
-
если предположить, что тРНК, передавшая аминокислоту рибосоме,
диссоциирует
с рибосомы медленнее, чем происходит повторное
ацилирование
этой тРНК новой аминокислотой, то может быть эффективным повторное использование этой же тРНК для той же аминокислоты в этом участке мРНК. В таком случае можно ожидать локальные паттерны кодонного предпочтения в разных участках гена, если на близком расстоянии закодировано несколько одинаковых аминокислот. Такие паттерны были обнаружены в
эукариотах
, в частности, в генах ответа на стресс, а явление получило название кодонной автокорреляции. Автокорреляция была наиболее выражена для изоакцепторных кодонов редких тРНК высоко экспрессирующихся генов
.
Методы детекции и количественного измерения
Предложено несколько способов измерения степени выраженности кодонного предпочтения.
-
Наиболее известная мера предложена Shapr & Li в 1986 году
.
Индекс отношения использования синонимичных кодонов
(relative synonymous codon usage) отражает то, насколько отклоняется частота использования конкретного кодона от ожидаемой частоты при равномерном распределении синонимичных кодонов:
, где
— число j-х кодонов, кодирующих i-ую аминокислоту, n — число синонимичных кодонов для i-й аминокислоты.
-
Авторами RSCU был также предложен
— мера адаптации гена к кодонному предпочтению. Эта мера определяется как
среднее геометрическое
значений относительной адаптивности для всех кодонов в гене:
, где
— ген,
— число кодонов в гене,
— относительная адаптивность
-го кодона в гене. Относительная адаптивность кодона рассчитывается следующим образом:
, где
— количество в гене
-ых кодонов, соответствующих
-ой аминокислоте,
— количество в гене кодонов наиболее представленного типа (среди всех кодонов, соответствующих
-ой аминокислоте).
-
Другой подход к оценке кодонного предпочтения основан на использовании
энтропии Шеннона
. Этот подход нашёл применение в ряде статистик (например, SCUO
).
Также существуют методы для оценки различий кодонного предпочтения в разных генах. В их основе могут лежать
метод главных компонент
,
метод k средних
,
метод максимального правдоподобия
.
Многие из них реализованы в виде отдельных программ
.
Примеры
Предпочтение кодонов у бактерий
В 2012 году группой учёных был обнаружен один из аспектов кодонного предпочтения в бактериях. С помощью рибосомного профайлинга на бактериях
E. coli
и
B. subtilis
было показано, что наличие в теле гена последовательностей, похожих на
последовательность Шайна — Дальгарно
(ШД), вызывает остановку трансляции. Это задаёт направление для характера предпочтения кодонов: ШД-подобные последовательности в генах избегаются. Остановка объясняется гибридизацией ШД-подобной последовательности с антиШД-последовательностью в составе рибосомы. Несмотря на то, что на пары кодонов, способных к образованию ШД-подобной последовательности, действует отбор, они всё же встречаются в последовательностях. На это можно смотреть с двух разных точек зрения. Во-первых, не для любой пары аминокислот можно подобрать «правильные» кодоны, которые не будут гибридизоваться с рибосомой, то есть действие отбора ограничено аминокислотной последовательностью. Во-вторых, такие участки могут нести регуляторную функцию. Остановки рибосомы могут использоваться для регуляции сопряжённого с трансляцией фолдинга или
транскрипции
(которая в бактериях также сопряжена с трансляцией)
.
Предпочтение кодонов у насекомых
В результате исследования 6698
ортологов
из 12 видов
Drosophila
было показано, что во всех видах, кроме одного, существует предпочтение кодонов, заканчивающихся на G или C. У
наблюдался сдвиг в сторону кодонов, заканчивающихся на А или Т. В большинстве генов наблюдался положительный отбор на кодоны, заканчивающиеся на G или C; в небольшой части генов сдвиг кодонного состава был вызван мутационным процессом. Наиболее сильный отбор был показан у группы
melanogaster
.
У
пчёл
в генах, расположенных в GC-бедных регионах, наблюдается намного большее разнообразие в предпочтении кодонов и аминокислот, чем в генах, расположенных в GC-богатых регионах
.
Биотехнологическое значение
Экспрессия функциональных белков в модельных организмах (таких, как бактерии)
повсеместно используется в
биотехнологии
. Такие технологии часто сталкиваются с трудностями, связанными с экспрессией белка вне родного организма. Для оптимизации синтеза применяется редизайн последовательности гена, направленный на модификацию зоны инициации трансляции, изменение структурных элементов мРНК и изменение паттерна предпочтения кодонов, чтобы получившаяся последовательность была максимально похожа на последовательности используемого организма
. Для модификации целевого гена применяют как
сайт-направленный мутагенез
, так и ресинтез всего гена
. Помимо этого может подвергаться модификации и сам используемый организм, например, в нём могут быть так изменены уровни экспрессии генов тРНК, чтобы состав пула тРНК соответствовал кодонным предпочтениям целевого гена
.
Тем не менее, подобных оптимизаций может быть недостаточно, либо они могут приводить к тому, что функциональный продукт синтезироваться не будет. Стратегия оптимизации кодонов основывается на трех предположениях:
-
Минорные кодоны уменьшают скорость синтеза
пептидов
.
-
Синонимичные замены не влияют на структуру и функции белка.
-
Замена минорных кодонов на синонимичные мажорные приводит к увеличению скорости синтеза пептидов
.
Поскольку не у всех организмов и не во всех генах кодонный состав коррелирует с уровнем экспрессии, предположения 1 и 3 выполняются не всегда. Предположение 2 также выполняется не всегда: первичная последовательность влияет на ритм движения рибосомального комплекса по мРНК, что, в свою очередь, влияет на правильность сворачивания полипептидной цепи в пространственную структуру. Более того, первичная последовательность участвует в
комплементарных
взаимодействиях — формировании
вторичной структуры
мРНК, а также взаимодействии и
рибосомальными
и различными
малыми РНК
. Все это может повлиять на инициацию, элонгацию, паузы и терминацию транскрипции, а также реинициацию, фреймшифты и стабильность мРНК
.
Примечания
-
↑
Hershberg R.
,
Petrov D. A.
(англ.)
// Annual review of genetics. — 2008. — Vol. 42. — P. 287—299. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Behura S. K.
,
Severson D. W.
(англ.)
// Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society. — 2013. — Vol. 88,
no. 1
. — P. 49—61. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Andersson G. E.
,
Sharp P. M.
(англ.)
// Microbiology (Reading, England). — 1996. — Vol. 142 ( Pt 4). — P. 915—925. —
.
[
]
-
Andersson S. G.
,
Sharp P. M.
(англ.)
// Journal of molecular evolution. — 1996. — Vol. 42,
no. 5
. — P. 525—536. —
.
[
]
-
↑
Duret L.
(англ.)
// Current opinion in genetics & development. — 2002. — Vol. 12,
no. 6
. — P. 640—649. —
.
[
]
-
↑
Ikemura T.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 1985. — Vol. 2,
no. 1
. — P. 13—34. —
.
[
]
-
↑
Chen S. L.
,
Lee W.
,
Hottes A. K.
,
Shapiro L.
,
McAdams H. H.
(англ.)
// Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 2004. — Vol. 101,
no. 10
. — P. 3480—3485. —
doi
:
. —
.
[
]
-
↑
Grantham R.
,
Gautier C.
,
Gouy M.
,
Mercier R.
,
Pavé A.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 1980. — Vol. 8,
no. 1
. — P. 49—62. —
.
[
]
-
↑
Gouy M.
,
Gautier C.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 1982. — Vol. 10,
no. 22
. — P. 7055—7074. —
.
[
]
-
↑
Sharp P. M.
,
Cowe E.
,
Higgins D. G.
,
Shields D. C.
,
Wolfe K. H.
,
Wright F.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 1988. — Vol. 16,
no. 17
. — P. 8207—8211. —
.
[
]
-
↑
Bulmer M.
(англ.)
// Genetics. — 1991. — Vol. 129,
no. 3
. — P. 897—907. —
.
[
]
-
Shields D. C.
,
Sharp P. M.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 1987. — Vol. 15,
no. 19
. — P. 8023—8040. —
.
[
]
-
Shields D. C.
,
Sharp P. M.
,
Higgins D. G.
,
Wright F.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 1988. — Vol. 5,
no. 6
. — P. 704—716. —
.
[
]
-
Kanaya S.
,
Kinouchi M.
,
Abe T.
,
Kudo Y.
,
Yamada Y.
,
Nishi T.
,
Mori H.
,
Ikemura T.
(англ.)
// Gene. — 2001. — Vol. 276,
no. 1-2
. — P. 89—99. —
.
[
]
-
Knight R. D.
,
Freeland S. J.
,
Landweber L. F.
(англ.)
// Genome biology. — 2001. — Vol. 2,
no. 4
. — P. 0010. —
.
[
]
-
Kanaya S.
,
Yamada Y.
,
Kinouchi M.
,
Kudo Y.
,
Ikemura T.
(англ.)
// Journal of molecular evolution. — 2001. — Vol. 53,
no. 4-5
. — P. 290—298. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Kanaya S.
,
Yamada Y.
,
Kudo Y.
,
Ikemura T.
(англ.)
// Gene. — 1999. — Vol. 238,
no. 1
. — P. 143—155. —
.
[
]
-
Yamao F.
,
Andachi Y.
,
Muto A.
,
Ikemura T.
,
Osawa S.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 1991. — Vol. 19,
no. 22
. — P. 6119—6122. —
.
[
]
-
Francino M. P.
,
Ochman H.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 2001. — Vol. 18,
no. 6
. — P. 1147—1150. —
.
[
]
-
↑
Duret L.
,
Mouchiroud D.
(англ.)
// Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 1999. — Vol. 96,
no. 8
. — P. 4482—4487. —
.
[
]
-
↑
Akashi H.
(англ.)
// Genetics. — 1995. — Vol. 139,
no. 2
. — P. 1067—1076. —
.
[
]
-
↑
Akashi H.
,
Kliman R. M.
,
Eyre-Walker A.
(англ.)
// Genetica. — 1998. — Vol. 102-103,
no. 1-6
. — P. 49—60. —
.
[
]
-
↑
Akashi H.
,
Schaeffer S. W.
(англ.)
// Genetics. — 1997. — Vol. 146,
no. 1
. — P. 295—307. —
.
[
]
-
Sawyer S. A.
,
Hartl D. L.
(англ.)
// Genetics. — 1992. — Vol. 132,
no. 4
. — P. 1161—1176. —
.
[
]
-
McVean G. A.
,
Vieira J.
(англ.)
// Genetics. — 2001. — Vol. 157,
no. 1
. — P. 245—257. —
.
[
]
-
↑
Nielsen R.
,
Bauer Du Mont V. L.
,
Hubisz M. J.
,
Aquadro C. F.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 2007. — Vol. 24,
no. 1
. — P. 228—235. —
doi
:
. —
.
[
]
-
DuMont V. B.
,
Fay J. C.
,
Calabrese P. P.
,
Aquadro C. F.
(англ.)
// Genetics. — 2004. — Vol. 167,
no. 1
. — P. 171—185. —
.
[
]
-
Fedorov A.
,
Saxonov S.
,
Gilbert W.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 2002. — Vol. 30,
no. 5
. — P. 1192—1197. —
.
[
]
-
Sharp P. M.
,
Li W. H.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 1987. — Vol. 4,
no. 3
. — P. 222—230. —
.
[
]
-
↑
Sharp P. M.
,
Bailes E.
,
Grocock R. J.
,
Peden J. F.
,
Sockett R. E.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 2005. — Vol. 33,
no. 4
. — P. 1141—1153. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Akashi H.
(англ.)
// Genetics. — 1994. — Vol. 136,
no. 3
. — P. 927—935. —
.
[
]
-
Marais G.
,
Duret L.
(англ.)
// Journal of molecular evolution. — 2001. — Vol. 52,
no. 3
. — P. 275—280. —
.
[
]
-
Stoletzki N.
,
Eyre-Walker A.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 2007. — Vol. 24,
no. 2
. — P. 374—381. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Eyre-Walker A.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 1996. — Vol. 13,
no. 6
. — P. 864—872. —
.
[
]
-
Shah P.
,
Gilchrist M. A.
(англ.)
// PLoS genetics. — 2010. — Vol. 6,
no. 9
. — P. e1001128. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Warnecke T.
,
Hurst L. D.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 2007. — Vol. 24,
no. 12
. — P. 2755—2762. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Thanaraj T. A.
,
Argos P.
(англ.)
// Protein science : a publication of the Protein Society. — 1996. — Vol. 5,
no. 8
. — P. 1594—1612. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Gu W.
,
Zhou T.
,
Wilke C. O.
(англ.)
// Public Library of Science for Computational Biology. — 2010. — Vol. 6,
no. 2
. — P. e1000664. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Tuller T.
,
Carmi A.
,
Vestsigian K.
,
Navon S.
,
Dorfan Y.
,
Zaborske J.
,
Pan T.
,
Dahan O.
,
Furman I.
,
Pilpel Y.
(англ.)
// Cell. — 2010. — Vol. 141,
no. 2
. — P. 344—354. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Fredrick K.
,
Ibba M.
(англ.)
// Cell. — 2010. — Vol. 141,
no. 2
. — P. 227—229. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Cannarozzi G.
,
Schraudolph N. N.
,
Faty M.
,
von Rohr P.
,
Friberg M. T.
,
Roth A. C.
,
Gonnet P.
,
Gonnet G.
,
Barral Y.
(англ.)
// Cell. — 2010. — Vol. 141,
no. 2
. — P. 355—367. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Sharp P. M.
,
Li W. H.
(англ.)
// Journal of molecular evolution. — 1986. — Vol. 24,
no. 1-2
. — P. 28—38. —
.
[
]
-
Sharp P. M.
,
Li W. H.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 1987. — Vol. 15,
no. 3
. — P. 1281—1295. —
.
[
]
-
Zeeberg B.
(англ.)
// Genome research. — 2002. — Vol. 12,
no. 6
. — P. 944—955. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Wan X. F.
,
Xu D.
,
Kleinhofs A.
,
Zhou J.
(англ.)
// BMC evolutionary biology. — 2004. — Vol. 4. — P. 19. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Su M. W.
,
Lin H. M.
,
Yuan H. S.
,
Chu W. C.
(англ.)
// Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology. — 2009. — Vol. 16,
no. 11
. — P. 1539—1547. —
doi
:
. —
.
[
]
-
↑
Kloster M.
,
Tang C.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 2008. — Vol. 36,
no. 11
. — P. 3819—3827. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Angellotti M. C.
,
Bhuiyan S. B.
,
Chen G.
,
Wan X. F.
(англ.)
// Nucleic acids research. — 2007. — Vol. 35. — P. 132—136. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Puigbò P.
,
Aragonès L.
,
Garcia-Vallvé S.
(англ.)
// BMC research notes. — 2010. — Vol. 3. — P. 87. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Li G. W.
,
Oh E.
,
Weissman J. S.
(англ.)
// Nature. — 2012. — Vol. 484,
no. 7395
. — P. 538—541. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Vicario S.
,
Moriyama E. N.
,
Powell J. R.
(англ.)
// BMC evolutionary biology. — 2007. — Vol. 7. — P. 226. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Jørgensen F. G.
,
Schierup M. H.
,
Clark A. G.
(англ.)
// Molecular biology and evolution. — 2007. — Vol. 24,
no. 2
. — P. 611—619. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Itakura K.
,
Hirose T.
,
Crea R.
,
Riggs A. D.
,
Heyneker H. L.
,
Bolivar F.
,
Boyer H. W.
(англ.)
// Science (New York, N.Y.). — 1977. — Vol. 198,
no. 4321
. — P. 1056—1063. —
.
[
]
-
Gustafsson C.
,
Govindarajan S.
,
Minshull J.
(англ.)
// Trends in biotechnology. — 2004. — Vol. 22,
no. 7
. — P. 346—353. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Kink J. A.
,
Maley M. E.
,
Ling K. Y.
,
Kanabrocki J. A.
,
Kung C.
(англ.)
// The Journal of protozoology. — 1991. — Vol. 38,
no. 5
. — P. 441—447. —
.
[
]
-
Nambiar K. P.
,
Stackhouse J.
,
Stauffer D. M.
,
Kennedy W. P.
,
Eldredge J. K.
,
Benner S. A.
(англ.)
// Science (New York, N.Y.). — 1984. — Vol. 223,
no. 4642
. — P. 1299—1301. —
.
[
]
-
Kane J. F.
(англ.)
// Current opinion in biotechnology. — 1995. — Vol. 6,
no. 5
. — P. 494—500. —
.
[
]
-
↑
Mauro V. P.
,
Chappell S. A.
(англ.)
// Trends in molecular medicine. — 2014. — Vol. 20,
no. 11
. — P. 604—613. —
doi
:
. —
.
[
]
Литература
-
Novoa E. M.
,
Ribas de Pouplana L.
(англ.)
// Trends in genetics : TIG. — 2012. — Vol. 28,
no. 11
. — P. 574—581. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Behura S. K.
,
Severson D. W.
(англ.)
// Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society. — 2013. — Vol. 88,
no. 1
. — P. 49—61. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Angov E.
(англ.)
// Biotechnology journal. — 2011. — Vol. 6,
no. 6
. — P. 650—659. —
doi
:
. —
.
[
]
-
Sharp P. M.
,
Emery L. R.
,
Zeng K.
(англ.)
// Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences. — 2010. — Vol. 365,
no. 1544
. — P. 1203—1212. —
doi
:
. —
.
[
]