, митохондриальная
Обозначения
Символы
CAS
HGNC
OMIM
RefSeq
UniProt
Другие данные
Шифр КФ
Локус	6-я хр. ,
?

супероксиддисмутаза 3 , внеклеточная
Обозначения
Символы
CAS
HGNC
OMIM
RefSeq
UniProt
Другие данные
Шифр КФ
Локус	4-я хр. , pter-q21
?

Супероксиддисмутаза (СОД, КФ ) относится к группе антиоксидантных ферментов . Вместе с каталазой и другими антиоксидантными ферментами она защищает организм человека от постоянно образующихся высокотоксичных кислородных радикалов . Супероксиддисмутаза катализирует дисмутацию супероксида в кислород и пероксид водорода . Таким образом, она играет важнейшую роль в антиоксидантной защите практически всех клеток, так или иначе находящихся в контакте с кислородом. Одним из редких исключений является молочнокислая бактерия и родственные ей молочнокислые бактерии , использующие иной механизм защиты от образующегося супероксида.

Реакция

Реакцию дисмутации супероксида, катализируемую супероксиддисмутазой, можно разбить на две части (парциальные реакции) следующим образом:

• M ⁽ⁿ⁺¹⁾⁺ − СОД + O ₂ ⁻ → M ⁿ⁺ − СОД + O ₂
• M ⁿ⁺ − СОД + O ₂ ⁻ + 2H ⁺ → M ⁽ⁿ⁺¹⁾⁺ − СОД + H ₂ O ₂ .

где M (переходный металл ) = Cu (n=1) ; Mn (n=2) ; Fe (n=2) ; Ni (n=2).

В данной реакции катиона металла осцилирует между n и n+1.

Типы

Введение

Существует несколько форм супероксиддисмутазы в зависимости от типа переходного металла- кофактора активного центра фермента : Cu , Zn -СОД ( медь как кофактор активного центра и цинк как кофактор, стабилизирующий ), Mn -СОД (с марганцем в активном центре), а также менее распространённые Fe -СОД (с железом )) и Ni -СОД (с никелем ).

• Цитозоль практически всех эукариотических клеток содержит супероксиддисмутазу типа Cu,Zn-СОД. Это самая распространённая супероксиддисмутаза и единственная коммерчески доступная форма фермента (как правило выделенная либо из эритроцитов , либо из печени быка: PDB от 29 марта 2008 на Wayback Machine , EC 1.15.1.1). Cu,Zn-СОД является гомодимером (то есть состоящим из двух одинаковых субъединиц), молекулярная масса 32,5 кДа. Субъединицы белка связаны друг с другом в первую очередь и . Медь и цинк связаны с белковой частью молекулы через гистидиновые остатки.
• Митохондрии эукариотических клеток и многие бактерии содержат супероксиддисмутазу с Mn (Mn-СОД). Например, митохондриальная СОД человека: PDB (недоступная ссылка) , EC 1.15.1.1, молекулярная масса 86-88 кДа. Марганец в этом ферменте координирован с белком через 3 гистидина и аспартат и с водой либо гидроксильным лигандом в зависимости от окислительного состояния Mn (Mn(II) или Mn(III)).
• E. coli и многие другие бактерии содержат формы фермента с железом (Fe-СОД), другие — с марганцем (Mn-СОД), а некоторые — оба эти типа. ( E. coli Fe-SOD: PDB от 29 марта 2008 на Wayback Machine , EC 1.15.1.1). Активные центры Mn- и Fe-СОД содержат те же аминокислоты в боковых цепях.

Человек

В организме человека существует три типа СОД. СОД1 находится в цитоплазме , СОД2 — в митохондрии , а СОД3 — это внеклеточная (экстраклеточная) форма. Первая форма — димерная, тогда как вторая и третья формы — тетрамерные (состоящие из 4 равных субъединиц). СОД1 и СОД3 содержат медь в активном центре и цинк как структурный компонент, а СОД2 содержит марганец в активном центре. Гены этих форм локализуются соответственно в хромосомах 21, 6 и 4 (21q22.1, 6q25.3 и 4p15.3-p15.1). Цитозольная СОД1 является небольшим белком с молекулярной массой 32,5 кДа, молекулярная масса митохондриальной СОД2 — около 86-88 кДа. Экстраклеточная СОД3 представляет собой самую крупную супероксиддисмутазу, молекулярная масса — 135 кДа.

Биохимия

Супероксидный радикал (O ₂ ⁻ ) спонтанно довольно быстро дисмутирует в кислород O ₂ и пероксид водорода H ₂ O ₂ (~10 ⁵ M ⁻¹ s ⁻¹ при pH 7). Тем не менее, супероксид ещё быстрее реагирует с некоторыми другими молекулами-мишенями, такими как оксид азота NO, образуя при этом пероксинитрит . Однако супероксиддисмутаза обладает самой высокой известной каталитической скоростью реакции (~10 ⁹ M ⁻¹ s ⁻¹ ). Реакция лимитирована только частотой столкновения супероксида с ферментом (т. н. ), благодаря чему супероксиддисмутаза защищает клетку от повреждающего действия супероксида.

Физиология

Супероксид является одним из основных прооксидантов в клетке, поэтому СОД играет одну из ключевых ролей в антиоксидантной защите организма. Роль этого фермента была показана экспериментально: мыши, у которых отсутствует митохондриальная СОД, выживают лишь несколько дней после рождения, так как у них развивается сильный окислительный стресс .

Роль в патологии

Мутации СОД1 у человека могут вызывать амиотрофический латеральный склероз , заболевание моторных нейронов . Механизм развития этого заболевания при этих мутациях, однако, не известен, так как ферментативная активность супероксиддисмутазы при этом не изменяется.

Ссылки

1. A.V. Peskin, C.C. Winterbourn. A microtiter plate assay for superoxide dismutase using a water-soluble tetrazolium salt (WST-1) (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2000. — Vol. 293 . — P. 157—166 .
2. Campana, F. Topical superoxide dismutase reduces post-irradiation breast cancer ibrosis (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2004. — Vol. 8 , no. 1 . — P. 109—116 .
3. Li, Y.; Huang, T. T.; Carlson, E. J.; Melov, S.; Ursell, P. C.; Olson, J. L.; Noble, L. J.; Yoshimura, M. P.; Berger, C.; Chan, P. H.; et al. Dilated cardiomyopathy and neonatal lethality in mutant mice lacking manganese superoxide dismutase. Nat. Genet. 11:376-381; 1995.
4. Elchuri, S.; Oberley, T. D.; Qi, W.; Eisenstein, R. S.; Jackson Roberts, L.; Van Remmen, H.; Epstein, C. J.; Huang, T. T. CuZnSOD deficiency leads to persistent and widespread oxidative damage and hepatocarcinogenesis later in life. Oncogene 24:367-380; 2005.
5. Muller, F. L.; Song, W.; Liu, Y.; Chaudhuri, A.; Pieke-Dahl, S.; Strong, R.; Huang, T. T.; Epstein, C. J.; Roberts, L. J., 2nd; Csete, M.; Faulkner, J. A.; Van Remmen, H. Absence of CuZn superoxide dismutase leads to elevated oxidative stress and acceleration of age-dependent skeletal muscle atrophy. Free Radic. Biol. Med. 40:1993-2004; 2006.
6. Sentman, M. L.; Granstrom, M.; Jakobson, H.; Reaume, A.; Basu, S.; Marklund, S. L. Phenotypes of mice lacking extracellular superoxide dismutase and copper- and zinc-containing superoxide dismutase. J. Biol. Chem. 281:6904-6909; 2006.

См. также

• Каталаза
• Пероксиредоксины
• Диэтилдитиокарбамат натрия

Ссылки

• OMIM (SOD1), OMIM (SOD2), OMIM (SOD3) and OMIM (ALS)
• Роль супероксиддисмутазы в старении.