Interested Article - Кофактор F430

F 430 простетическая группа фермента метилкофермент-М-редуктазы. Был обнаружен в метаногенных Археях . Этот фермент катализирует высвобождение метана на финальной стадии метаногенеза :
CH 3 -S-CoM + HS-CoB → CH 4 + CoB-S-S-CoM

Корфин в контексте других тетрапирролов

Природа использует различные тетрапирролы гемы , хлорофилл и кобаламин . F 430 — самый восстановленный из природных тетрапирролов — в нём всего пять двойных связей . Это исключительное тетрапиррольное производное называется корфином . Из-за относительного недостатка сопряжённых связей, он жёлтый, а не ярко пурпурно-красный, что характерно для более ненасыщенных тетрапирролов. Это также единственное тетрапиррольное производное, содержащие никель . Ni(II) слишком мал для N4 связывающего сайта корфина, что заставляет макроцикл принимать более сморщенную форму.

Предполагаемый механизм метаногенеза

Активная форма F 430 содержит Ni(I), аналогично восстановленному кофактору B 12 , содержащему Co(I). Принимая во внимание, что электроны Co(I) находятся в d 8 и потому демагнитен, электроны Ni(I) находятся в состоянии d 9 и парамагнитен. Механизм согласно которому природа разрывает CH3-S связь в метилкоферменте M до конца ещё неясен, хотя и известно, что кофермент B и кофермент M могут пройти в канал оканчивающийся осевым сайтом никеля. Правдоподобный механизм предполагает передачу электронов с Ni(I) (так он становится Ni(II)), и этот перенос электронов инициирует формирование CH 4 . В результате соединения радикала метил-КоМ с HS группой коэнзима высвобождается протон (H + ) и захватывает один электрон, отнимает его у Ni(II) и восстанавливая Ni(I) .

Структура F 430 была исследована при помощи рентгенокристаллографии и ядерно магнитно-резонансной спектрографии .

Бескислородное окисление метана

F 430 в высоких концентрациях содержится в бактериях, которые по-видимому вовлечены в обратный метаногенез, вовремя которого метан превращается в метил-КоМ. В организмах которые осуществляют эту удивительную реакцию до 7 % и веса составляет никелевый протеин .

Источники

  1. Thauer R.K. (англ.) // Microbiology : journal. — 1998. — Vol. 144 , no. 9 . — P. 2377—2406 . — doi : . — . 17 мая 2020 года.
  2. Finazzo C., Harmer J., Bauer C., et al. Coenzyme B induced coordination of coenzyme M via its thiol group to Ni(I) of F 430 in active methyl-coenzyme M reductase (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — April ( vol. 125 , no. 17 ). — P. 4988—4989 . — doi : . — .
  3. Farber G., Keller W.,Kratky C., Jaun B., Pfaltz A., Spinner C., Kobelt A., Eschenmoser A. Coenzyme F 430 from Methanogenic Bacteria: Complete Assignment of Configuration Based on an X-ray Analysis of 12,13-diepi-F430 Pentamethyl Ester and n NMR Spectroscopy (англ.) // (англ.) : journal. — 1991. — Vol. 74 . — P. 697—716 .
  4. Kruger M., Meyerdierks A., Glockner F.O., et al. A conspicuous nickel protein in microbial mats that oxidize methane anaerobically (англ.) // Nature : journal. — 2003. — December ( vol. 426 , no. 6968 ). — P. 878—881 . — doi : . — .
Источник —

Same as Кофактор F430