Interested Article - PRPF8

Обрабатывающий сплайсинг пре-мРНК фактор 8 ( англ. «Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 ) — белок , который у человека кодируется геном PRPF8.

Сплайсинг пре-мРНК проходит две последовательные стадии трансэтерификации. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом как U2- так и U12- зависимых сплайсосом , и создаёт что необходимо для катализа стадии II процесса сплайсинга пре-мРНК. Он производит несколько повторов WD, которые функционируют в межбелковых взаимодействиях. Этот белок имеет некоторое сходство с дрожжевым белком Prp8. Этот ген является кандидатом для аутосомно-доминантного пигментного ретинита .

Взаимодействия

PRPF8, как было выявлено, взаимодействует с WDR57 и EFTUD2.

Примечания

McKie A.B., McHale J.C., Keen T.J., Tarttelin E.E., Goliath R., van Lith-Verhoeven J.J., Greenberg J., Ramesar R.S., Hoyng C.B., Cremers F.P., Mackey D.A., Bhattacharya S.S., Bird A.C., Markham A.F., Inglehearn C.F. Mutations in the pre-mRNA splicing factor gene PRPC8 in autosomal dominant retinitis pigmentosa (RP13) (англ.) // (англ.) ( : journal. — Oxford University Press , 2001. — July ( vol. 10 , no. 15 ). — P. 1555—1562 . — doi : . — .
Luo H.R., Moreau G.A., Levin N., Moore M.J. The human Prp8 protein is a component of both U2- and U12-dependent spliceosomes (англ.) // RNA : journal. — 1999. — July ( vol. 5 , no. 7 ). — P. 893—908 . — doi : . — . — PMC .
.
Ewing, Rob M; Chu Peter, Elisma Fred, Li Hongyan, Taylor Paul, Climie Shane, McBroom-Cerajewski Linda, Robinson Mark D., O'Connor Liam, Li Michael, Taylor Rod, Dharsee Moyez, Ho Yuen, Heilbut Adrian, Moore Lynda, Zhang Shudong, Ornatsky Olga, Bukhman Yury V., Ethier Martin, Sheng Yinglun, Vasilescu Julian, Abu-Farha Mohamed, Lambert Jean-Philippe, Duewel Henry S., Stewart Ian I., Kuehl Bonnie, Hogue Kelly, Colwill Karen, Gladwish Katharine, Muskat Brenda, Kinach Robert, Adams Sally-Lin, Moran Michael F., Morin Gregg B., Topaloglou Thodoros, Figeys Daniel. Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry (англ.) // (англ.) ( : journal. — England, 2007. — Vol. 3 , no. 1 . — P. 89 . — doi : . — . — PMC .
↑ Achsel, T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp S; Lührmann R. The Human U5-220kD Protein (hPrp8) Forms a Stable RNA-Free Complex with Several U5-Specific Proteins, Including an RNA Unwindase, a Homologue of Ribosomal Elongation Factor EF-2, and a Novel WD-40 Protein (англ.) // (англ.) ( : journal. — UNITED STATES, 1998. — November ( vol. 18 , no. 11 ). — P. 6756—6766 . — ISSN . — . — PMC .

Ссылки

Литература

Grainger R.J., Beggs J.D. Prp8 protein: At the heart of the spliceosome (неопр.) // RNA. — 2005. — Т. 11 , № 5 . — С. 533—557 . — doi : . — . — PMC .
Garcia-Blanco M.A., Anderson G.J., Beggs J., Sharp P.A. A mammalian protein of 220 kDa binds pre-mRNAs in the spliceosome: a potential homologue of the yeast PRP8 protein (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1990. — Vol. 87 , no. 8 . — P. 3082—3086 . — doi : . — . — PMC .
Pinto A.L., Steitz J.A. The mammalian analogue of the yeast PRP8 splicing protein is present in the U4/5/6 small nuclear ribonucleoprotein particle and the spliceosome (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86 , no. 22 . — P. 8742—8746 . — doi : . — . — PMC .
Bach M., Winkelmann G., Lührmann R. 20S small nuclear ribonucleoprotein U5 shows a surprisingly complex protein composition (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86 , no. 16 . — P. 6038—6042 . — doi : . — . — PMC .
Anderson G.J., Bach M., Lührmann R., Beggs J.D. Conservation between yeast and man of a protein associated with U5 small nuclear ribonucleoprotein (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 342 , no. 6251 . — P. 819—821 . — doi : . — .
Umen J.G., Guthrie C. Prp16p, Slu7p, and Prp8p interact with the 3' splice site in two distinct stages during the second catalytic step of pre-mRNA splicing (англ.) // RNA : journal. — 1996. — Vol. 1 , no. 6 . — P. 584—597 . — . — PMC .
Goliath R; Shugart Y; Janssens P; Weissenbach, J; Beighton, P; Ramasar, R; Greenberg, J. Fine localization of the locus for autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 17p (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1995. — Vol. 57 , no. 4 . — P. 962—964 . — . — PMC .
Greenberg J., Goliath R., Beighton P., Ramesar R. A new locus for autosomal dominant retinitis pigmentosa on the short arm of chromosome 17 (англ.) // (англ.) ( : journal. — Oxford University Press , 1994. — Vol. 3 , no. 6 . — P. 915—918 . — doi : . — .
Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // (англ.) ( : journal. — Elsevier , 1994. — Vol. 138 , no. 1—2 . — P. 171—174 . — doi : . — .
Kojis TL; Heinzmann C; Flodman P; Ngo, JT; Sparkes, RS; Spence, MA; Bateman, JB; Heckenlively, J.R. Map refinement of locus RP13 to human chromosome 17p13.3 in a second family with autosomal dominant retinitis pigmentosa (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1996. — Vol. 58 , no. 2 . — P. 347—355 . — . — PMC .
Reyes J.L., Kois P., Konforti B.B., Konarska M.M. The canonical GU dinucleotide at the 5' splice site is recognized by p220 of the U5 snRNP within the spliceosome (англ.) // RNA : journal. — 1996. — Vol. 2 , no. 3 . — P. 213—225 . — . — PMC .
Hinz M., Moore M.J., Bindereif A. Domain analysis of human U5 RNA. Cap trimethylation, protein binding, and spliceosome assembly (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271 , no. 31 . — P. 19001—19007 . — doi : . — .
Chiara M.D., Palandjian L., Feld Kramer R., Reed R. Evidence that U5 snRNP recognizes the 3' splice site for catalytic step II in mammals (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1997. — Vol. 16 , no. 15 . — P. 4746—4759 . — doi : . — . — PMC .
Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Maruyama K; Suyama, A; Sugano, S. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // (англ.) ( : journal. — Elsevier , 1997. — Vol. 200 , no. 1—2 . — P. 149—156 . — doi : . — .
Achsel T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp, S; Lührmann, R. The Human U5-220kD Protein (hPrp8) Forms a Stable RNA-Free Complex with Several U5-Specific Proteins, Including an RNA Unwindase, a Homologue of Ribosomal Elongation Factor EF-2, and a Novel WD-40 Protein (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1998. — Vol. 18 , no. 11 . — P. 6756—6766 . — . — PMC .
Reyes JL; Gustafson EH; Luo HR; Moore, Melissa J.; Konarska, Maria M. The C-terminal region of hPrp8 interacts with the conserved GU dinucleotide at the 5' splice site (англ.) // RNA : journal. — 1999. — Vol. 5 , no. 2 . — P. 167—179 . — doi : . — . — PMC .
Makarov E.M., Makarova O.V., Achsel T., Lührmann R. The human homologue of the yeast splicing factor prp6p contains multiple TPR elements and is stably associated with the U5 snRNP via protein-protein interactions (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2000. — Vol. 298 , no. 4 . — P. 567—575 . — doi : . — .
Le Hir H., Moore M.J., Maquat L.E. Pre-mRNA splicing alters mRNP composition: evidence for stable association of proteins at exon–exon junctions (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2000. — Vol. 14 , no. 9 . — P. 1098—1108 . — . — PMC .
McHale J.C., McKie A.B., Tarttelin E.E., Inglehearn C.F. Expression map of human chromosome region 17p13.3, spanning the RP13 dominant retinitis pigmentosa locus, the Miller-Dieker lissencephaly syndrome (MDLS) region, and a putative tumour suppressor locus (англ.) // (англ.) ( : journal. — (англ.) ( , 2000. — Vol. 88 , no. 3—4 . — P. 225—229 . — doi : . — .