Interested Article - Поли(АДФ-рибоза)-полимеразы

ainsleigh
  • 2020-10-12
  • 1

АДФ-рибоза
Никотинамидадениндинуклеотид

Поли(АДФ-рибоза)-полимеразы ( PARP ) — ферменты , катализирующие поли- АДФ-рибозилирование , один из видов посттрансляционной модификации белков.

Поли(АДФ-рибоза)-полимеразы ( КФ 2.4.2.30 в Международной классификации ферментов) относятся к подклассу пентозилтрансфераз (КФ 2.4.2) класса гликозилтрансфераз (КФ 2.4) и катализируют реакцию переноса АДФ-рибозила (остатка аденозиндифосфат -рибозы) на поли-АДФ-рибозильную цепь, связываемую с белком, в которой донором АДФ-рибозы является никотинамидадениндинуклеотид (НАД + ) :

НАД + + (АДФ-D-рибозил) n -Акцептор (АДФ-D-рибозил) n+1 + никотинамид

Акцепторами для разных PARP являются разные белки-субстраты, вследствие чего эти ферменты имеют различные физиологические функции . В отличие от PARP, которые используют для модификации одного акцептора несколько молекул НАД + и синтезируют поли-АДФ-рибозу, ферменты, катализирующие моно-АДФ-рибозилирование, не относятся к суперсемейству PARP и имеют в номенклатуре ферментов другой порядковый номер.

Наиболее известным представителем суперсемейства является фермент PARP-1, участвующий в репарации повреждений ДНК и ремоделировании хроматина за счет поли-АДФ-рибозилирования гистонов. Поскольку при апоптозе ДНК подвергается расщеплению, каспазы расщепляют и тем самым инактивируют PARP-1, предотвращая репарацию расщепляемой ДНК.

Клиническое значение и ингибиторы PARP

В некоторых случаях нарушения в комплексе репарации ДНК приводят к канцерогенезу . Так, например, у человека мутации генов-онкосупрессоров BRCA1 и ( англ. breast cancer susceptibility protein ), кодирующих белки, участвующие в репарации ДНК, ведут к возникновению рака молочной железы . Подавление активности PARP-1 при химиотерапии в этом случае ведет к апоптозу клеток, ДНК которых повреждена цитостатическими препаратами . В настоящее время ряд ингибиторов PARP ( , , , ) проходят клинические испытания в качестве противораковых препаратов.

Гены PARP человека и кодируемые ими ферменты

У человека имеется 16 генов, кодирующих эти ферменты, образующие одно суперсемейство , все они имеют гомологичный каталитический домен и, по-видимому, происходят от одного предкового фермента.

Ген Хромосома Код доступа в базе данных UniProt Максимальная длина полипептида (а.о.) * Максимальная расчетная масса продукта (кДа) * Альтернативные наименования продукта Домены, кроме каталитического Примечания
PARP-1 1q41-42 от 12 апреля 2011 на Wayback Machine 1014 113 ADPRT, PPOL BRCT, PARP-регуляторный, ДНК-связывающий
PARP-2 14q11.2 от 12 апреля 2011 на Wayback Machine 583 * 66 * ADPRT2, ADPRTL2 PARP-регуляторный
PARP-3 3p21 от 14 ноября 2010 на Wayback Machine 533 60 ADPRT3, ADPRTL3
PARP-4 13q11 от 21 августа 2011 на Wayback Machine 1724 193 ADPRTL1, KIAA0177, PARPL, VPARP BRCT, VIT, VWFA
PARP-5a 8p23.1 от 19 января 2011 на Wayback Machine 1327 * 142 * TNKS1, танкираза 1 анкириновый, SAM
PARP-5b 10q23.03 от 21 июня 2010 на Wayback Machine 1166 127 TNKL, TNKS2, танкираза 2 анкириновый, SAM
PARP-6 15q22.3 от 6 августа 2010 на Wayback Machine 630 * 71 * обнаружен транскрипт, белок неохарактеризован
PARP-7 3q25.31 от 11 мая 2011 на Wayback Machine 657 76 TIPARP ДНК-связывающий, WWE
PARP-8 5q11.2 от 4 ноября 2012 на Wayback Machine 854 * 96 *
PARP-9 3q13-q21 от 6 августа 2010 на Wayback Machine 854 * 96 * BAL macro
PARP-10 8q24.3 от 3 ноября 2012 на Wayback Machine 1025 110
PARP-11 12p13.3 от 6 августа 2010 на Wayback Machine 331 * 39 * C12orf6 WWE
PARP-12 7q34 от 25 октября 2012 на Wayback Machine 701 79 ZC3HDC1 ДНК-связывающий, WWE
PARP-14 3q21.1 от 10 ноября 2012 на Wayback Machine 1720 * 194 * BAL2, KIAA1268 macro, WWE
PARP-15 3q21.1 от 10 ноября 2012 на Wayback Machine 656 * 73 * BAL3 macro
PARP-16 15q22.2 от 10 ноября 2012 на Wayback Machine 322 * 36 * C15orf30 обнаружен транскрипт, белок неохарактеризован

* Обозначены продукты генов, для которых также известны изоформы меньшей длины и молекулярной массы.

Примечания

  1. . Дата обращения: 14 мая 2013. 20 июня 2013 года.
  2. Нилов, ДК; Пушкарев, СВ; Гущина, ИВ; Манасарян, ГА; Кирсанов, КИ; Швядас, ВК (2020). "Моделирование фермент-субстратных комплексов поли(ADP-рибозо)полимеразы 1 человека". Биохимия . 85 : 116–125. doi : .
  3. Piskunova TS, Yurova MN, Ovsyannikov AI, Semenchenko AV, Zabezhinski MA, Popovich IG, Wang ZQ, Anisimov VN. Deficiency in Poly(ADP-ribose) Polymerase-1 (PARP-1) Accelerates Aging and Spontaneous Carcinogenesis in Mice. Curr Gerontol Geriatr Res. 2008:754190. Epub 2008 Apr 14.
  4. Espinoza LA, Smulson ME, Chen Z. Prolonged poly(ADP-ribose) polymerase-1 activity regulates JP-8-induced sustained cytokine expression in alveolar macrophages. Free Radic Biol Med. 2007 May 1;42(9):1430-40. Epub 2007 Feb 1.
  5. Zerfaoui M, Suzuki Y, Naura AS, Hans CP, Nichols C, Boulares AH. Nuclear translocation of p65 NF-kappaB is sufficient for VCAM-1, but not ICAM-1, expression in TNF-stimulated smooth muscle cells: Differential requirement for PARP-1 expression and interaction. Cell Signal. 2008 Jan;20(1):186-94. Epub 2007 Oct 12.
  6. Joseph A.; De Soto; Chu-Xia Deng. (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2006. — 15 July ( vol. 3 , no. 4 ). — P. 117—123 . — ISSN . 9 июля 2022 года.
  7. Дата обращения: 30 августа 2010. 5 марта 2016 года.
  8. Manasaryan, G; Suplatov, D; Pushkarev, S; Drobot, V; Kuimov, A; Švedas, V; Nilov, D (2021). "Bioinformatic analysis of the nicotinamide binding site in poly(ADP-ribose) polymerase family proteins". Cancers . 13 : 1201. doi : . PMID . {{ cite journal }} : Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) ( ссылка )


Ссылки

  • at bioreagents.com
  • at inotekcorp.com
  • at parplink.u-strasbg.fr
  • MeSH
  • от 28 марта 2010 на Wayback Machine Information Site
  • at trevigen.com
Источник —

ainsleigh
  • 2020-10-12
  • 1
  • Tags:

Same as Поли(АДФ-рибоза)-полимеразы

The title for the last searches