Interested Article - Гликозил-гидролазы
- 2021-05-22
- 1
Гликозил-гидролазы (или гликозидазы ) катализируют гидролиз гликозидных связей в молекулах углеводов , приводя к появлению двух более мелких молекул углеводов. Эти ферменты встречаются в клетках почти всех живых организмов . Гликозидазы выполняют множество разнообразных функций : деградация биомассы (например, целлюлозы и гемицеллюлозы ), участие в антибактериальной защите организма (например, лизоцим ), развитие патогенеза (например, вирусные нейраминидазы ), клеточный биосинтез (например, , вовлечённые в созревание N -гликозилированных гликопротеинов ). Гликозидазы вместе с гликозилтрансферазами образуют основу биологического аппарата синтеза и разрушения гликозидных связей.
Классификация
Гликозил-гидролазы объединены в КФ 3.2.1 как ферменты, катализирующие гидролиз O - или S - гликозидов . Все гликозидазы имеют номера КФ 3.2.1.x, при этом x может быть от 1 до 165 в зависимости от субстратной специфичности фермента. На основе молекулярного механизма катализируемой ими реакции гликозидазы могут быть разбиты на две группы. Представители одной из них обращают (inverting), а другой — сохраняют (retaining) путём двойного обращения аномерную конфигурацию субстрата у продукта реакции гидролиза . Гликозил-гидролазы также могут быть классифицированы как экзо- или эндо-действующие, в зависимости от того, действуют ли они соответственно на концевой или внутренний моносахаридный остаток в углеводной цепи. Более современные классификации гликозил-гидролаз основаны на сравнении их аминокислотных последовательностей. Такие классификации обладают большой предсказательной силой в отношении возможных биохимических активностей неисследованных ферментов с недавно определёнными последовательностями. Впервые классификация всех известных на тот момент последовательностей гликозидаз была предложена в 1991 году . Близкородственные белки было предложено группировать в семейства. Впоследствии эволюционно родственные семейства стали объединять на более высоком иерархическом уровне в кланы . Такая двухуровневая классификация в настоящее время доступна на сайте
Недавние исследования позволили на основе двухуровневой классификации создать многоуровневую ( иерархическую ) классификацию гликозил-гидролаз и их гомологов :
Номенклатура
Большинство гликозил-гидролаз получили свои названия по основному субстрату. Наряду с этими названиями часто также используются и названия, данные по отщепляемому углеводному остатку. Для ряда гликозил-гидролаз применяются тривиальные названия. Ниже для примера приведены названия некоторых гликозидаз и соответствующие К. Ф. номера:
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- хитиназа ( )
- лизоцим или мурамидаза ( )
- нейраминидаза ( )
- кислая α-глюкозидаза или мальтаза ( )
- ( )
- α-галактозидаза или мелибиаза ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- трегалаза ( )
- ( )
- ( )
- гиалуронидаза ( )
- гиалуронидаза ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- α-N-ацетилгалактозаминидаза ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- эндо-альфа-N-ацетилгалактозаминидаза ( )
- ( )
- лактаза ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
- ( )
Примечания
- Sinnott, M. L. Chem. Rev. 1990, 90 , 1171—1202.
- Henrissat, B. Biochem. J. 1991, 280 , 309—316.
- Henrissat, B., Bairoch, A. Biochem. J. 1996, 316 , 695—696.
- Дата обращения: 17 января 2007. 7 октября 2006 года.
- Дата обращения: 9 июня 2011. 31 декабря 2013 года.
- 2021-05-22
- 1