Interested Article - Нуклеоморф

Строение хлоропласта криптофит

Нуклеомо́рф , или нуклеомо́рфа ( англ. Nucleomorph ) — маленькое рудиментарное ядро , находящееся между внешней и внутренней парами мембран в пластидах криптофитовых и хлорарахниофитовых водорослей . Они получили нуклеоморфы независимо друг от друга: от зелёной водоросли в случае хлорарахниофитовых и от красной водоросли в случае криптофитовых водорослей. Нуклеоморфы представляют собой остатки ядер зелёной и красной водорослей, поглощённых более крупным эукариотом .

Строение

Нуклеоморф располагается в перипластидном пространстве хлоропласта между двумя парами мембран, из которых внутренняя пара имеет цианобактериальное происхождение, а наружные происходят от промежуточного симбионта и конечного хозяина. В перипластидном пространстве также находятся рибосомы 80S, рРНК которых кодируется геномом нуклеоморфа .

Геном

Геномы нуклеоморфов — самые короткие и самые компактные эукариотические геномы. Их размер варьирует от 380—450 т. п . н . у хлорарахниофитовых до 450—845 т. п. н. у криптофитовых водорослей. По состоянию на 2017 год секвенированы геномы нуклеоморфов четырёх видов криптомонад и четырёх видов хлорарахниофитовых водорослей . Гены нуклеоморфа располагаются весьма компактно. Так, у криптофитовых водорослей на весь геном нуклеоморфа приходится от 0 до 24 интронов длиной не более 211 п. н. У хлорарахниофитовой водоросли интронов существенно больше (852), но их длина составляет всего 18—21 п. н. В большинстве случаев гены расположены очень близко друг к другу, и расстояние между двумя генами немногим больше 100 п. н. Существует гипотеза, что синтения генов нуклеоморфов обусловлена их близким расположением: межгенное расстояние столь мало, что рекомбинация между соседними генами сильно затруднена .

Большинство генов, находящихся в геномах нуклеоморфов, относятся к числу генов домашнего хозяйства : их белковые продукты задействованы в транскрипции , трансляции , фолдинге и деградации белков, при этом количество генов цианобактериального происхождения невелико. Как уже говорилось выше, нуклеоморфы криптофитовых и хлорарахниофитовых водорослей возникли независимо, но их эволюция шла параллельно, причём и в том, и в другом случае весьма короткие, содержащие мало генов геномы представлены всего тремя хромосомами .

Не найдено однозначного ответа на вопрос: пойдёт ли редукция нуклеоморфов дальше, и если нуклеоморфы стабильны, то каковы их функции в клетках . Поначалу было показано, что размер нуклеоморфа постепенно уменьшается и в конце концов он полностью исчезнет. Впоследствии, однако, было установлено, что в целом гены нуклеоморфов мутируют реже, чем ядерные гены, при этом фотосинтетические гены хлорарахниофитовых водорослей мутировали значительно чаще, чем таковые у криптофитовых водорослей .

Было выдвинуто предположение, что большая часть белков нуклеоморфа закодирована в ядре, например, нуклеоморфные гистоны и . При этом гистоны и кодируются в геноме нуклеоморфа, таким образом, нуклеоморфная нуклеосома содержит белки, закодированные двумя геномами, и регулируется конечным хозяином .

Судя по имеющимся данным, большинство генов нуклеоморфа перешло в ядро или было утеряно в течение короткого промежутка времени, а не постепенно. Иными словами, редукция нуклеоморфа сначала шла быстро, а потом замедлилась. Причины этого замедления неясны; до сих пор не найдено выгод для клетки от наличия нуклеоморфа. Возможно, что полному исчезновению нуклеоморфа мешает его компактизация, так как очень короткие интроны его генов не приспособлены под ядерные сплайсосомы , а перенос генов осложняется очень маленькими промежутками между ними .

генов нуклеоморфа также отличается от типичного для эукариот. Все компоненты гистонового кода, связанные с транскрипцией и репрессией генов, отсутствуют в нуклеоморфах хлорарахниофитовых водорослей. Гистоны криптомонад не так значительно отличаются от типичных эукариотических, однако и у криптомонад имеется ряд отличий от стандартного гистонового кода .

Примечания

  1. Мухина В. С. Возникновение и эволюция пластид // Журнал общей биологии. — 2014. — Т. 75 , № 5 . — С. 329—352 .
  2. , с. 12.
  3. Archibald J. M. , Lane C. E. // Journal of Heredity. — 2009. — 17 июля ( т. 100 , № 5 ). — С. 582—590 . — ISSN . — doi : . [ ]
  4. Reyes-Prieto A. , Weber A. P. , Bhattacharya D. (англ.) // Annual review of genetics. — 2007. — Vol. 41. — P. 147—168. — doi : . — . [ ]
  5. Suzuki S. , Shirato S. , Hirakawa Y. , Ishida K. (англ.) // Genome biology and evolution. — 2015. — Vol. 7, no. 6 . — P. 1533—1545. — doi : . — . [ ]
  6. Marinov G. K. , Lynch M. (англ.) // Biology direct. — 2016. — Vol. 11, no. 1 . — P. 18. — doi : . — . [ ]

Литература

  • Белякова Г. А., Дьяков Ю. Т., Тарасов К. Л. Ботаника: в 4 т. Т. 2. — М. : Издат. центр «Академия», 2006. — 320 с. — ISBN 978-5-7695-2750-1 .
Источник —

Same as Нуклеоморф