Interested Article - Метод Trim-Away

Метод Trim-Away — это метод быстрой принудительной высокоизбирательной (селективной) деградации эндогенных белков в клетках млекопитающих, который не требует предварительной модификации генома или матричной РНК . Поскольку избирательность метода Trim-Away основана на использовании антител , его можно применять к широкому спектру белков-мишеней с использованием готовых моноклональных антител . Trim-Away позволяет исследовать функцию белка в самых разных типах клеток . Разработан под началом Мелины Шух в сотрудничестве с Dean Clift .

Принцип действия

В основе метода лежит использование лигазы убиквитина - , которая связывается с высоким сродством с доменом кристаллизующегося фрагмента иммуноглобулина Fc антител . Во время заражения TRIM21 транспортирует систему убиквитин-протеасом к связанным с антителом патогенам, что приводит к их разрушению. Разработаны многочисленные модификации этого метода .

PROTAC

Широкое распространение получили также методы PROTAC ( ) использующие гетеробифункциональные молекулы, которые соединяют белок подлежащий удалению с E3 убиквитин-лигазой .

Примечания

Clift D. , McEwan W. A. , Labzin L. I. , Konieczny V. , Mogessie B. , James L. C. , Schuh M. (англ.) // Cell. — 2017. — doi : . — . [ ]
от 1 декабря 2017 на Wayback Machine . ScienceDaily, 16 November 2017, Max-Planck-Gesellschaft.
. Дата обращения: 1 марта 2019. 2 марта 2019 года.
James L. C. , Keeble A. H. , Khan Z. , Rhodes D. A. , Trowsdale J. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 2007. — Vol. 104, no. 15 . — P. 6200—6205. — doi : . — . [ ]
Röth, S., Fulcher, L. J., & Sapkota, G. P. (2019). Advances in targeted degradation of endogenous proteins. Cellular and Molecular Life Sciences, 76(14), 2761–2777 doi : PMC
Sun, X., Gao, H., Yang, Y., He, M., Wu, Y., Song, Y., ... & Rao, Y. (2019). PROTACs: great opportunities for academia and industry. Signal Transduction and Targeted Therapy, 4, 64(2019). doi : PMC
Gao, H., Sun, X., & Rao, Y. (2020). PROTAC Technology: Opportunities and Challenges. ACS Medicinal Chemistry Letters, 11(3), 237-240.