Interested Article - CHD4

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4 фермент , кодируемый у человека геном CHD4 .

Продукт этого гена относится к семейству геликаз SNF2/RAD54. Оно представляет собой основной компонент нуклеосомного ремоделирования и комплекса деацетилаз и играет важную роль в эпигенетической репрессии транскрипции . У пациентов с дерматомиозитом вырабатываются антитела против этого белка.

Взаимодействия

CHD4, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1 , гистондезацетилазой 2 , MTA2 , SATB1 и ATR .

Примечания

  1. Seelig H.P., Moosbrugger I., Ehrfeld H., Fink T., Renz M., Genth E. The major dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen is a presumed helicase involved in transcriptional activation (англ.) // (англ.) : journal. — 1995. — November ( vol. 38 , no. 10 ). — P. 1389—1399 . — doi : . — .
  2. Seelig H.P., Renz M., Targoff I.N., Ge Q., Frank M.B. Two forms of the major antigenic protein of the dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen (англ.) // (англ.) : journal. — 1996. — November ( vol. 39 , no. 10 ). — P. 1769—1771 . — doi : . — .
  3. .
  4. Yao, Ya-Li; Yang Wen-Ming. The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2003. — October ( vol. 278 , no. 43 ). — P. 42560—42568 . — ISSN . — doi : . — .
  5. Grozinger, C M; Hassig C A; Schreiber S L. Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — UNITED STATES, 1999. — April ( vol. 96 , no. 9 ). — P. 4868—4873 . — ISSN . — doi : . — . — PMC .
  6. Tong, J K; Hassig C A; Schnitzler G R; Kingston R E; Schreiber S L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — ENGLAND, 1998. — October ( vol. 395 , no. 6705 ). — P. 917—921 . — ISSN . — doi : . — .
  7. Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2003. — February ( vol. 278 , no. 9 ). — P. 7234—7239 . — ISSN . — doi : . — .
  8. Schmidt, D R; Schreiber S L. Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4 (англ.) // Biochemistry : journal. — UNITED STATES, 1999. — November ( vol. 38 , no. 44 ). — P. 14711—14717 . — ISSN . — doi : . — .
  9. Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances (англ.) // Nature : journal. — England, 2002. — October ( vol. 419 , no. 6907 ). — P. 641—645 . — ISSN . — doi : . — .

Литература

  • Denslow S.A., Wade P.A. The human Mi-2/NuRD complex and gene regulation (англ.) // (англ.) . — 2007. — Vol. 26 , no. 37 . — P. 5433—5438 . — doi : . — .
  • Ge Q., Nilasena D.S., O'Brien C.A., et al. Molecular analysis of a major antigenic region of the 240-kD protein of Mi-2 autoantigen (англ.) // (англ.) : journal. — 1995. — Vol. 96 , no. 4 . — P. 1730—1737 . — doi : . — . — PMC .
  • Woodage T., Basrai M.A., Baxevanis A.D., et al. Characterization of the CHD family of proteins (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — Vol. 94 , no. 21 . — P. 11472—11477 . — doi : . — . — PMC .
  • Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.P., et al. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1998. — Vol. 95 , no. 2 . — P. 279—289 . — doi : . — .
  • Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., et al. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395 , no. 6705 . — P. 917—921 . — doi : . — .
  • Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., et al. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13 , no. 15 . — P. 1924—1935 . — doi : . — . — PMC .
  • Schmidt D.R., Schreiber S.L. Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4 (англ.) // Biochemistry : journal. — 1999. — Vol. 38 , no. 44 . — P. 14711—14717 . — doi : . — .
  • Humphrey G.W., Wang Y., Russanova V.R., et al. Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276 , no. 9 . — P. 6817—6824 . — doi : . — .
  • Andersen J.S., Lyon C.E., Fox A.H., et al. Directed proteomic analysis of the human nucleolus (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 12 , no. 1 . — P. 1—11 . — doi : . — .
  • Koipally J., Georgopoulos K. A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277 , no. 31 . — P. 27697—27705 . — doi : . — .
  • Saito M., Ishikawa F. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277 , no. 38 . — P. 35434—35439 . — doi : . — .
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99 , no. 26 . — P. 16899—16903 . — doi : . — . — PMC .
  • Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., et al. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278 , no. 9 . — P. 7234—7239 . — doi : . — .
  • Kwan A.H., Gell D.A., Verger A., et al. Engineering a protein scaffold from a PHD finger (неопр.) // Structure. — 2004. — Т. 11 , № 7 . — С. 803—813 . — doi : . — .
  • Shimono Y., Murakami H., Kawai K., et al. Mi-2 beta associates with BRG1 and RET finger protein at the distinct regions with transcriptional activating and repressing abilities (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 278 , no. 51 . — P. 51638—51645 . — doi : . — .
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36 , no. 1 . — P. 40—5 . — doi : . — .
  • Williams C.J., Naito T., Arco P.G., et al. The chromatin remodeler Mi-2beta is required for CD4 expression and T cell development (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press , 2004. — Vol. 20 , no. 6 . — P. 719—733 . — doi : . — .
  • Lehner B., Sanderson C.M. A protein interaction framework for human mRNA degradation (англ.) // (англ.) : journal. — 2004. — Vol. 14 , no. 7 . — P. 1315—1323 . — doi : . — . — PMC .
Источник —

Same as CHD4