Interested Article - Феррохелатаза

Феррохелатаза , также протопорфирин феррохелатаза или протогем ферро-лиаза (протопорфиринобразующая) — фермент (КФ ) из класса лиаз , который катализирует последнюю (8-ю) реакцию биосинтеза гема — превращение молекул протопорфирина IX в гем Б . У человека фермент кодируется геном , локализованный на коротком плече (p-плече) 18-ой хромосомы . Реакция, катализируемая данным ферментом:

протогем ( гем Б ) + 2H + = протопорфирин IX + Fe +2 .

Феррохелатаза обнаруживается в больших количествах в митохондриях эритропоэтических клеток ( проэритробластах , эритробластах , ретикулоцитах ) и гепатоцитах печени.

Структура

Феррохелатаза человека представляет собой гомодимер, состоящий из двух полипептидных цепей, включающие 359 аминокислотных остатков. Его общая молекулярная масса составляет 85,07 кДа . Каждая субъединица состоит из пяти областей: последовательности митохондриальной локализации, N-концевого домена, двух складчатых доменов и С-концевого удлинения. Остатки 1-62 образуют домен митохондриальной локализации, который расщепляется в посттрансляционной модификации. Свёрнутые домены содержат в общей сложности 17 α-спиралей и 8 β-листов. С-концевое удлинение содержит три из четырёх цистеиновых остатков (Cys-403, Cys-406, Cys-411), которые координируют каталитический железосерный кластер (2Fe-2S). Четвёртый координирующий цистеин находится в N-концевом домене (Cys-196) .

Активный карман феррохелтазы состоит из двух гидрофобных «губ» и гидрофильной внутренней части. Гидрофобные «губы», состоящие из высококонсервативных остатков 300-311, обращены к внутренней митохондриальной мембране и облегчают прохождение через мембрану малорастворимого субстрата протопорфирина IX и продукта гема. Внутренняя часть кармана активного центра содержит высококонсервативную кислую поверхность, которая облегчает извлечение протонов из протопорфирина. Остатки гистидина и аспартата примерно в 20 ангстремах (2 нм) от центра активного центра на стороне митохондриального матрикса фермента координируют связывание ионов металлов .

Механизм катализа

Активный центр феррохелатазы с субстратом протопорфирина IX зелёного цвета. Показаны остатки: гидрофобные группы, удерживающие протопорфирин IX (жёлтый), анионный путь переноса протона (тёмно-синий), остатки металлирования (голубой), каталитический гистидин (красный).

Механизм металлирования (связывание ионов железа) протопорфирина человека остаётся в стадии изучения. Многие исследователи выдвинули гипотезу о том, что искажение макроцикла порфирина является ключом к катализу. Исследователи, изучающие феррохелатазу Bacillus subtilis , предлагают механизм введения железа в протопорфирин, при котором фермент плотно захватывает кольца B, C и D, изгибая кольцо A на 36°. Обычно кольцо А плоское и данное искажение подвергает неподелённую пару электронов азота в кольце A мигрировать к иону Fe 2+ . Последующее исследование выявило искажение на 100° в протопорфирине, связанное с феррохелатазой человека. Высококонсервативный остаток гистидина (His-183 у B. subtilis , His-263 у человека) необходим для определения типа искажения, а также действует как исходный акцептор протона из протопорфирина . Анионные остатки образуют путь, облегчающий отвод протонов от каталитического гистидина . Фратаксин связывает железо с матриксной стороны феррохелатазы, где остатки аспартата и гистидина в обоих белках координируют перенос железа в феррохелатазу . Два остатка аргинина и тирозина в активном центре (Arg-164, Tyr-165) могут осуществлять окончательное металлирование .

Функции

В процессе биосинтеза гема феррохелатаза катализирует встраивание двухвалентного железа (Fe 2+ ) в протопорфирин IX с образованием гема Б. Фермент локализован на обращённой к матриксу стороне внутренней митохондриальной мембраны. Феррохелатаза является наиболее известным представителем семейства ферментов, которые добавляют катионы двухвалентных металлов к тетрапиррольным структурам . Например, хелатаза магния добавляет магний к протопорфирину IX на первой стадии биосинтеза бактериохлорофилла .

Гем Б является важной простетической группой многих белков и ферментов. В частности, гем Б играет ключевую роль в качестве переносчика кислорода в гемоглобине в эритроцитах и миоглобине в мышечных клетках. Кроме того, гем Б обнаружен в цитохроме b , ключевом компоненте убихинол-цитохром с оксидоредуктазы ( комплекс III ) окислительного фосфорилирования .

Клиническое значение

Дефекты феррохелатазы создают накопление протопорфирина IX , вызывая заболевание (ЭПП) . Заболевание может быть результатом различных мутаций гена FECH, большинство из которых носят аутосомно-доминантный характер с низкой клинической пенетрантностью. Клинически у пациентов с ЭПП проявляется ряд симптомов, от бессимптомных до крайне болезненной светочувствительности. Менее чем в пяти процентах случаев накопление протопорфирина в печени приводит к холестазу (блокировке оттока жёлчи из печени в тонкую кишку) и терминальной печёночной недостаточности .

В случаях отравления свинцом происходит ингибирование активности феррохелатазы, что частично приводит к порфирии .

Взаимодействия

Феррохелатаза взаимодействует со многими другими ферментами, участвующими в биосинтезе, катаболизме и транспорте гема, включая протопорфириногеноксидазу, АЛК-синтазу , ABCB10, ABCB7, и митоферрин-1 . Многочисленные исследования показали существование олигомерного комплекса, который обеспечивает передачу субстрата и координацию общего метаболизма железа и порфирина по всей клетке . N-метилмезопорфирин (N-MeMP) является конкурентным ингибитором протопорфирина IX и считается аналогом переходного состояния. Таким образом, N-MeMP широко используется в качестве стабилизирующего лиганда для определения структуры с помощью рентгеновской кристаллографии . Фратаксин действует как шаперон Fe 2+ и образует комплексы с феррохелатазой на стороне митохондриального матрикса . Феррохелатаза также может вставлять ионы других двухвалентных металлов в протопорфирин. Некоторые ионы, такие как Zn 2+ , Ni 2+ и Co 2+ , образуют другие металлопорфирины, в то время как ионы более тяжёлых металлов, такие как Mn 2+ , Pb 2+ , Hg 2+ и Cd 2+ , препятствуют высвобождению продукта после металлирования .

См. также

Примечания

  1. . Дата обращения: 28 апреля 2023. 8 июня 2019 года.
  2. . Дата обращения: 28 апреля 2023. 6 июля 2017 года.
  3. Wu, Chia-Kuei; Dailey, Harry A.; Rose, John P.; Burden, Amy; Sellers, Vera M.; Wang, Bi-Cheng (1 February 2001). "The 2.0 Å structure of human ferrochelatase, the terminal enzyme of heme biosynthesis". Nature Structural Biology . 8 (2): 156—160. doi : . PMID . S2CID .
  4. Lecerof, D.; Fodje, M.; Hansson, A.; Hansson, M.; Al-Karadaghi, S. (March 2000). "Structural and mechanistic basis of porphyrin metallation by ferrochelatase". Journal of Molecular Biology . 297 (1): 221—232. doi : . PMID .
  5. Karlberg, Tobias; Hansson, Mattias D.; Yengo, Raymond K.; Johansson, Renzo; Thorvaldsen, Hege O.; Ferreira, Gloria C.; Hansson, Mats; Al-Karadaghi, Salam (May 2008). . Journal of Molecular Biology . 378 (5): 1074—1083. doi : . PMC . PMID .
  6. Bencze, Krisztina Z.; Yoon, Taejin; Mill?n-Pacheco, C?sar; Bradley, Patrick B.; Pastor, Nina; Cowan, J. A.; Stemmler, Timothy L. (2007). . Chemical Communications (18): 1798—1800. doi : . PMC . PMID . из оригинала 13 августа 2023 . Дата обращения: 28 апреля 2023 .
  7. Leeper, F. J. (1985). "The biosynthesis of porphyrins, chlorophylls, and vitamin B12". Natural Product Reports . 2 (1): 19—47. doi : . PMID .
  8. Berg, Jeremy. Biochemistry / Jeremy Berg, John Tymoczko, Lubert Stryer. — 7th. — New York : W.H. Freeman, 2012. — ISBN 9781429229364 .
  9. James, William D. Andrews' Diseases of the Skin: clinical Dermatology / William D. James, Timothy G. Berger. — Saunders Elsevier, 2006. — ISBN 0-7216-2921-0 .
  10. Rüfenacht, U.B.; Gouya, L.; Schneider-Yin, X.; Puy, H.; Schäfer, B.W.; Aquaron, R.; Nordmann, Y.; Minder, E.I.; Deybach, J.C. (1998). . The American Journal of Human Genetics . 62 (6): 1341—52. doi : . PMC . PMID .
  11. Agency for Toxic Substances & Disease Registry. Дата обращения: 9 февраля 2021. 24 января 2021 года.
  12. Medlock, Amy E.; Shiferaw, Mesafint T.; Marcero, Jason R.; Vashisht, Ajay A.; Wohlschlegel, James A.; Phillips, John D.; Dailey, Harry A.; Liesa, Marc (19 August 2015). . PLOS ONE . 10 (8): e0135896. Bibcode : . doi : . PMC . PMID .
  13. Chen, W.; Dailey, H. A.; Paw, B. H. (28 April 2010). . Blood . 116 (4): 628—630. doi : . PMC . PMID .
  14. Medlock, A.; Swartz, L.; Dailey, T. A.; Dailey, H. A.; Lanzilotta, W. N. (29 January 2007). . Proceedings of the National Academy of Sciences . 104 (6): 1789—1793. Bibcode : . doi : . PMC . PMID .
  15. Medlock, Amy E.; Carter, Michael; Dailey, Tamara A.; Dailey, Harry A.; Lanzilotta, William N. (October 2009). . Journal of Molecular Biology . 393 (2): 308—319. doi : . PMC . PMID .
Источник —

Same as Феррохелатаза