Поставки в воинские части Ju 188 начались в августе 1943 года. Первый боевой вылет Ju 188 совершили в ночь на 16 октября 1943 года во время налёта на
Лондон
, где Ju 188 выполняли функции целеуказателей. Ju 188 выполняли авианалёты на Лондон и
Англию
до сентября 1944 года. Позже Ju 188 были приписаны группе, находившийся в
Норвегии
. Около 10 Ju 188 вошли в состав
ВВС Франции
, где эксплуатировались до
1951 года
(
авиация ВМС Франции
).
Варианты
Ju 188E
— экипаж составлял 4 человека. Выпущено 263 самолёта.
Ju 188F
— экипаж составлял 3 человека. Выпущено 222 самолёта.