Interested Article - Восстановительный пентозофосфатный цикл

Схема цикла. Чёрные кружки — атомы углерода, красные — кислорода, фиолетовые — фосфора, маленькие белые окружности — атомы водорода

Восстановительный пентозофосфатный цикл , или цикл Кальвина — серия биохимических реакций, осуществляемая при фотосинтезе растениями (в строме хлоропластов ), цианобактериями , прохлорофитами и пурпурными бактериями , а также многими бактериями-хемосинтетиками , является наиболее распространённым из механизмов автотрофной фиксации углекислого газа .

Назван в честь американского биохимика Мелвина Кальвина . Часто используются альтернативные названия, указывающие на роль коллег Кальвина в открытии данного биохимического пути (например: цикл Кальвина — Бенсона или цикл Кальвина — Бенсона — Бассама ).

Стадии

В цикл вовлекаются АТФ и НАДФ·Н , образованные в ЭТЦ фотосинтеза , углекислый газ и вода; основным продуктом является глицеральдегид -3-фосфат. Поскольку АТФ и НАДФ·Н могут образовываться в разных метаболических путях, цикл не следует рассматривать строго привязанным к световой фазе фотосинтеза.

Общий баланс реакций цикла можно представить уравнением:

3 CO ₂ + 6 НАДФ·Н + 6 H ⁺ + 9 АТФ → C ₃ H ₇ O ₃ -PO ₃ + 3 H ₂ O + 6 НАДФ ⁺ + 9 АДФ + 8 Ф _н

Две молекулы глицеральдегид-3-фосфата используются для синтеза глюкозы .

Цикл состоит из трёх стадий: на первой под действием фермента рибулозобисфосфат-карбоксилаза/оксигеназа происходит присоединение CO ₂ к рибулозо-1,5-бисфосфату и расщепление полученной гексозы на две молекулы 3-фосфоглицериновой кислоты ( 3-ФГК ). На второй 3-ФГК восстанавливается до глицеральдегид-3-фосфата (фосфоглицеральдегида, ФГА), часть молекул которого выходит из цикла для синтеза глюкозы, а другая часть используется в третьей стадии для регенерации рибулозо-1,5-бисфосфата.

Карбоксилирование

Карбоксилирование рибулозо-1,5-бисфосфата (5-углеродное соединение) осуществляется РуБисКО в несколько стадий. На первой кетонная группа рибулозы восстанавливается до спиртовой, между 2 и 3 атомами углерода устанавливается двойная связь . Полученное соединение нестабильно и именно оно карбоксилируется с образованием 2-карбокси-3-кето-D-арабитол-1,5-бисфосфата. Его структурный аналог ингибирует весь процесс. Новое, уже 6-углеродное соединение, также нестабильно и распадается на две молекулы 3-фосфоглицериновой кислоты ( 3-фосфоглицерат , 3-ФГК ).

Восстановление

Восстановление 3-фосфоглицериновой кислоты (3-ФГК) происходит в две реакции.

Сначала каждая 3-ФГК с помощью и с затратой одной АТФ фосфорилируется, образуя 1,3-бисфосфоглицериновую кислоту ( 1,3-бисфосфоглицерат ).

Затем под действием бисфосфоглицериновая кислота восстанавливается НАД(Ф)·H (у растений и цианобактерий; у пурпурных и зелёных бактерий восстановителем является НАД·H) параллельно с отщеплением одного остатка фосфорной кислоты. Образуется глицеральдегид-3-фосфат (фосфоглицеральдегид, ФГА , триозофосфат). Обе реакции обратимы.

Регенерация

На последней стадии 5 молекул глицеральдегид-3-фосфатов превращаются в три молекулы рибулозо-1,5-бисфосфата . Вначале под действием глицеральдегид-3-фосфат изомеризуется в дигидроксиацетонфосфат . Фруктозобисфосфатальдолаза объединяет их во фруктозо-6-фосфат с отщеплением остатка фосфорной кислоты. Затем следует ряд реакций перестройки углеродных скелетов и образуется рибулозо-5-фосфат. Он фосфорилируется и рибулозо-1,5-бисфосфат регенерирует.

Правила работы ферментов и строения , актуальные для стадии регенерации восстановительного пентозофосфатного пути и для неокислительной стадии окислительного пентозофосфатного пути :

В проекции Фишера на хиральных атомах углерода у всех фосфо-производных альдоз и рибулозы (кетоза) гидроксилы направлены вправо, у всех остальных фосфо-производных кетоз гидроксил на ${\ce {C3}}$ направлен влево, а все остальные - вправо.
Фосфоальдозы - акцепторы углерод-содержащих групп, их альдегидная группа при акцепции исчезает, они становятся фосфокетозами; фосфокетозы - доноры углерод-содержащих групп, их кето-группа при переносе не исчезает, а они сами становятся фосфоальдозами. Следующие 2 правила согласуются с этим правилом.
Транскетолазы катализируют перенос двухуглеродного кето-фрагмента с фосфокетозы на фосфоальдозу, при этом фосфокетоза становится фосфоальдозой, а фосфоальдоза, акцептировавшая углерод, лишается альдегидной группы, получает кето-группу, и становится фосфокетозой.

Правила только для цикла Кальвина:

Альдолаза катализирует объединение фосфоальдозы и фосфокетозы (дигидроксиацетонфосфат), альдегидная группа исчезает, кето-группа остаётся, образуется фосфокетоза.
Бисфосфатазы гидролизуют , высвобождая неорганический фосфат в раствор . Превращения образуемых фосфосахаров катализируются транскетолазой и альдолазой.

Открытие

С 1940-х гг. Мелвин Кальвин работал над проблемой фотосинтеза ; к 1957 с помощью CO ₂ , меченного по углероду , выяснил химизм усвоения растениями CO ₂ (восстановительный карбоновый цикл Кальвина) при фотосинтезе. Нобелевская премия по химии ( 1961 ).

См. также

Примечания

Govindjee, Helen Bassham, Susan Bassham. // Photosynthesis Research. — April 2016. — Т. 128 , вып. 1 . — С. 3–13 . — ISSN . — doi : . 3 декабря 2017 года.
Bob B. Buchanan, Wilhelm Gruissem, Russel L. Jones. . — Second Edition. — Chichester, West Sussex. — XV, 1264 с. — ISBN 9780470714218 .
Taiz, L., E. Zeiger, 2002. Plant Physiology. Sinauer Associates, Sunderland, MA 01375, USA
↑ Robert Horton, Laurence A. Moran, David Rawn, Gray Scrimgeour, Marc Perry. Principles of Biochemistry, 5th Edition. — Pearson, 2011. — С. 464. — 824 с. — ISBN 9780321707338 .