Дейл Купер ( Кайл Маклахлен ) по-прежнему находится в Чёрном Вигваме. В Твин Пиксе в отеле «Грейт Нортерн» Бен Хорн ( Ричард Беймер ) знакомит своего брата Джерри ( ), поглощенного экспериментами с наркотическими веществами, со своей новой помощницей Беверли ( Эшли Джадд ). Маргарет Лантерман, известная как Дама с поленом ( ), звонит помощнику шерифа Хоуку — Ястребу( Майкл Хорс ) и сообщает, что нечто, связанное с агентом Купером, пропало, и найти это поможет наследие Ястреба. В Нью-Йорке некий Сэм Колби ( ) сидит в одиночестве в охраняемом помещении и наблюдает за пустым стеклянным кубом. Его знакомая Трейси Барберато ( Мэйделин Зима ) навещает его, но Сэму запрещено впускать кого-либо в комнату. Однажды, в отсутствие охранника ( Майкл Биспинг ) Сэм разрешает ей войти в помещение. Они начинают заниматься любовью, а в это время в кубе материализуется некая сущность, выходит оттуда и жестоко их убивает.

Жена директора школы Филлис Хастингс ( ) приходит в камеру к мужу и обвиняет того в романе с Рут Дэвенпорт, Билл же говорит, что знает о её романе с адвокатом Джорджем ( ). Некая сущность материализуется и затем превращается в бродягу в соседней с Биллом камере. Филлис приезжает домой, где её ожидает чёрный Купер. После недолгой беседы он убивает Филлис из пистолета её любовника. Двойник пытается получить некую информацию от секретаря Хастингса с помощью своих сообщников, но приходит к выводу, что они его предали и хотят убить. Чёрный Купер убивает Джека и Дарью и узнаёт, что кто-то заплатил им за его убийство. Доппельгангер Купера связывается с бывшим агентом ФБР Филлипом Джеффрисом ( ), тот сообщает ему, что доппельгенгеру пора возвращаться в Чёрный Вигвам, а сам он будет с БОБом ( Фрэнк Силва ). После этого Двойник скачивает план тюрьмы, где сидит Рэй, из базы ФБР с помощью пароля Купера В Чёрном Вигваме Дейл Купер общается с Лорой ( Шерил Ли ) и Лиландом Палмерами ( Рэй Уайз ), а также с Майком ( ) и его рукой, которая стала говорящим деревом с подобием мозга. Куперу предстоит вернуться в реальный мир, а вместо него в Вигваме должен появиться его доппельгангер. Куперу удаётся выбраться из Вигвама, и он материализуется в стеклянном кубе в Нью-Йорке в тот момент, когда ещё живой Сэм встречает Трэйси у лифта и в комнате никого нет. Из стеклянного куба Купер проваливается в некое пространство.

Купер оказывается в неком здании, в котором женщина с зашитыми глазами ( ) выводит его на крышу. После этого женщина катапультируется в пространство, а Купер видит проплывающую гигантскую голову майора Бриггза ( Дон С. Дэвис ), которая говорит о «голубой розе». Купер возвращается в помещение, где встречает Ронетт Пуласки ( ), которая предостерегает предостерегает его от встречи с некой сущностью, которая настойчиво стучит в дверь. Доппельгангеру Купера по пути в тюрьму к Рэю становиться плохо, его тошнит, и он попадает в аварию. Его находят полицейские, один из них, понюхав рвотные массы чёрного Купера, попадает в больницу. Настоящий Купер находит портал и через электрическую розетку материализуется в Лас-Вегасе в съёмном доме, в котором другой доппельгангер Купера, Дуглас «Даги» Джонс ( Кайл Маклахлен ), встречается с проституткой Джейд ( ). Даги Джонса также тошнит, после чего он материализуется в Чёрном Вигваме, где Майк информирует доппельгангера Даги о том, что он был изготовлен с определённой целью, которая теперь выполнена. Даги исчезает, от него остаётся только кольцо и небольшой золотистый шарик, которые забирает Майк. Джейд обнаруживает Купера и принимает его за Даги; Даги-Купер ведет себя заторможено. Купер находит у себя в кармане ключ от номера 315 отеля «Грейт Нортерн» в Твин Пиксе. Некие люди намереваются убить Даги Джонса, но из-за случайности не видят Купера в машине Джейд и решают прикрепить взрывное устройство к его машине, оставщейся у дома. Несмотря на невменяемое состояние Купера, Джейд отвозит его к казино , выдав ему пять долларов и сказав, что там ему помогут. По стечению обстоятельств Купер разменивает деньги и начинает срывать джекпоты на игральных автоматах. В определении выигрышной машине ему подсказывает знак из Чёрного Вигвама — огонёк.

Купер срывает порядка 30 джекпотов в казино, выигрывая 425 тысячи долларов. Его принимают за Даги Джонса и, выдав ему мешок с выигранными деньгами, отправляют на лимузине домой. Его жена, Джени-И ( Наоми Уоттс ), которая также принимает Купера за Даги, взбешена его трёхдневным отсутствием, но резко меняется в настроении, когда видит выигранные деньги. Купер, который по-прежнему находится в близком к коматозному состоянии, остаётся в доме Даги. На следующее утро Куперу видится Майк; тот сообщает, один из двоих должен умереть. В Твин Пиксе к расследованию Ястреба подключается шериф Фрэнк Трумен ( Роберт Форстер ), брат Гарри Трумена. Бобби Бриггз ( Дэна Эшбрук ), ставший полицейским, говорит Трумену, что агент Купер был последним, кто видел его отца, майора Гарленда Бриггза, перед смертью. Сын Энди и Люси, Уолли Брандо ( Майкл Сера ), приезжает на мотоцикле к офису шерифа, чтобы перед отъездом пожелать здоровья его больному крёстному отцу шерифу Гарри Трумену.

Джени-И отвозит по-прежнему невменяемого Купера на работу Даги Джонса, страховую компанию «Счастливая 7-ка». Купер реагирует на статую ковбоя с пистолетом на улице, запах кофе, слова «агент» и «дела». Во время совещания Купер видит зелёный огонёк на лице коллеги ( Том Сайзмор ) и называет его лжецом. Босс ( ) Даги Джонса недоволен голословным обвинением и даёт Куперу пачку документов с тем, чтобы он поработал с ними дома, от этого будет зависеть его будущее в компании. Мальчик ( ), видевший как к машине Даги Джонса неизвестные прикрепили некое устройство, собирается исследовать его, но в этот момент бандиты пытаются угнать машину, и она взрывается, несколько бандитов гибнет, мальчик остается невредим. В казино приезжают высокопоставленные управленцы ( Джеймс Белуши и Роберт Неппер ), избивают администратора ( Бретт Гельман ) и увольняют его, обвинив в соучастии в невиданном выигрыше Купера. В Твин Пиксе Шелли Джонсон в очередной раз даёт деньги своей дочери Бекки ( Аманда Сайфред ), которая уезжает на машине со своим безработным мужем ( Калеб Лэндри Джонс ) и нюхает кокаин. Доктор Джекоби ( Расс Тэмблин ) выходит в эфир с речью, разоблачающей сразу несколько теорий заговора, в её конце выясняется, что целью была реклама покрашенных золотой краской лопат, которые он продаёт по 29,99 доллара. Среди слушающих речь — Джерри Хорн и Надин Хёрли ( Уэнди Роби ).

Полицейские отводят Даги-Купера домой после того, как они находят его слоняющимся возле офиса «Счастливой 7-ки». Джени-И получает в конверте фото Даги с Джейд и отчитывает Купера за измену Даги. Майк в очередном видении из Чёрного вигвама призывает Купера проснуться и не умирать. Купер садиться за работу с документами и по световым подсказкам рисует загадочные изображения лестниц. На следующий день босс Даги злится за это, пока не распознаёт закономерность в рисунках, передающих тревожную информацию, он благодарит Купера. Джени-И встречается с двумя бандитами, требующими деньги от Даги, и договаривается снизить долг с $52 000 до $25 000, после чего расплачивается деньгами из казино. Сообщник доппельгангера Купера — Данкан Тодд ( Патрик Фишлер ) в офисе получает сообщение в виде красного квадрата на своём ноутбуке и с большой предосторожностью достаёт конверт с чёрным пятном из сейфа. Неизвестный карлик ( ) получает идентичный конверт с фотографиями Даги и некой Лоррейн ( ), затем отправляется в офис Лоррейн и жестоко закалывает её и её коллег ножом для колки льда. Альберт в баре встречается с Дайаной ( Лора Дерн ), бывшей помощницей агента Купера, и просит о помощи. В Твин-Пиксе Ричард Хорн ( Эймон Фаррен ), внук Бенджамина Хорна, встречается с поставщиком наркотиков Редом ( Бальтазар Гетти ), который проделывает ряд пугающих манипуляций, но не причиняет Ричарду физического вреда. После этой встречи Ричард на взводе, он несётся по дороге и насмерть сбивает маленького мальчика ( ). Девушка Мириам узнает Ричарда, однако тот скрывается с места преступления. Это происходит на том же перекрёстке, где в своё время Майк общался с Лиландом и Лорой Палмерами. Карл Родд ( Гарри Дин Стэнтон ), владелец трейлерного парка близ Твин Пикс, становится свидетелем происшествия, он видит отлетающую в небо мерцающую сущность и пытается утешить мать ( ) погибшего мальчика.

Найденные Ястребом страницы оказываются частью дневника Лоры Палмер. Одна из записей содержит рассказ о сне Лоры, в котором Энни сообщает, что настоящий Купер пойман в ловушку в Вигваме. Фрэнк Трумен звонит доктору Хейворду ( ) и расспрашивает его о дне, когда Купер вернулся из Вигвама. В Бакхорне лейтенант Нокс узнает, что отпечатки пальцев Бриггса получены с тела, возраст которого около пятидесяти лет, в то время как майору должно быть за семьдесят. Чтобы выяснить, кто же сидит под именем Дейла Купера в тюрьме Южной Дакоты агенты ФБР устраивают очную ставку с Дайан, которая чувствует, что перед ней совсем другой человек. К Куперу-Джонсу на работу приходит полиция, чтобы допросить о возможных причинах взрыва его автомобиля. При выходе на Купера пытается напасть карлик, но ему видится Майк и просит использовать руку. Купер профессионально обезоруживает карлика.

Доппельгангер Купера угрожает Рэю пистолетом, требуя информацию, добытую у секретарши Хастингса. Рэй подстреливает Купера, так как пистолет чёрного Купера выведен из строя. Вокруг тела собираются призрачные люди, разрывают одежду и вынимают нечто наподобие мешка, в котором видно лицо БОБа. Рэй убегает и звонит Филлипу Джеффрису, сообщая, что убить доппельгангера не удалось. После показа выступления « Nine Inch Nails » зритель видит, как доппельгангер поднимается и открывает глаза.

Добравшись до фермы, раненный доппельгангер Купера встречает там еще одних сообщников: Хатча ( Тим Рот ) и Шанталь ( Дженнифер Джейсон Ли ), которым заказывает убийство Мёрфи, начальника тюрьмы. Он направляется в Вегас, звонит мистеру Тодду и отправляет SMS Дайане. В полиции Вегаса предполагают, что Даги Джонс участник программы защиты свидетелей, так как любые документы на его имя ранее 1997 года отсутствуют. Взяв образцы ДНК с его кофейного стаканчика, сыщики отправляются на поимку карлика Айка Шпигеля. В Твин Пиксе Бобби навещает свою мать ( ) вместе с шерифом Труменом и Ястребом, чтобы узнать о последнем дне Купера в Твин Пикс. Она рассказывает, что майор Бриггс предсказывал этот день: он просил передать им маленький металлический цилиндр. Бобби понимает как открыть цилиндр и открывает его. Внутри — два листка, на одном из которых начерчена схема и даты, а на втором обнаруживается часть расшифровки посланий из космоса, где фамилия Купера повторена дважды.

Ричард Хорн приходит к свидетельнице ДДТ Мириам ( ), которая сообщает, что написала письмо о произошедшем и отправила его шерифу Трумену. Он нападает на неё, включает газ и зажигает свечу в её трейлере, а звонит заместителю шерифа Чэду ( ), что бы тот перехватил письмо. Владельцы казино, Братья Митчам, видят по телевизору репортаж об аресте Айка и узнают в Купере «мистера Джекпота». Отметив физическую форму Купера, Джейни-И занимается с ним сексом. В своем собственном магазине занавесок Надин Хёрли смотрит передачу доктора Джакоби. Ричард грабит свою бабушку Сильвию ( ) в собственном доме. Та звонит Бену и требует у него возьместить ущерб, Бен отказывается. Дункан Тодд приказывает Энтони Синклеру, лживому коллеге Купера, обвинить Даги в отклонении выплаты страховки за поджог, стоивший Митчамам 30 миллионов долларов.

Несколько детей находят выползающую из кустов Мириам. Бекки, дочь Шелли, узнает, что её муж Стивен изменяет ей с Герстен Хейворд ( Алисия Уитт ). Она берет машину Шелли, мчится к квартире любовницы и стреляет через дверь. В закусочной родители Бекки, Шелли и Бобби, обсуждают этот инцидент. Шелли выбегает на улицу, чтобы поцеловаться с Редом. На улице в одной из машин ребенок ( ) стреляет из пистолета в закусочную, и в процессе наведения порядка в одной из машин Бобби обнаруживает взволнованную женщину ( ) с девочкой ( ) извергающей зелёную массу. Хастингс приводит ФБР на место, где он и Рут Дэвенпорт встретили майора Бриггса. Они находят тело Рут с координатами на одной из рук. В определенном месте вглядевшись в небо Гордон видит вихрь, а в нём чёрных бродяг, его чуть не засасывает в вихрь, но Альберт спасает его. В это время Дайана видит, как чёрный бродяга залезает в машину, где сидит Хастингс и убивает его.

Гордон и Альберт принимают Тэмми в отряд «Голубой Розы». Сара Палмер ( Грейс Забриски ) испытывает тревожный приступ в супермаркете, Ястреб приходит навестить её. Сара ведёт себя странно. Альберт прерывает романтический вечер Гордона и его подруги-француженки ( Беренис Марло ), чтобы показать ему сообщение направленное Дайане с вопросом о Лас-Вегасе. Гордон пока не понимает в чём суть.

Благодарные Митчамы дарят Даги и Бушнеллу подарки. Дункан Тодд заказывает Энтони Синклеру убийство Даги, тот приобретает яд у коррумпированного полицейского и подсыпает в кофе Даги, но затем выливает его и признается Бушнеллу в связях с Тоддом. Доппельгангер Купера приходит в дом в Монтане, где его поджидают Рэй и его банда, в том числе и Ричард Хорн. Он побеждает главаря банды ( Дерек Мирс ) в армрестлинге, а затем убивает его. Рэй рассказывает, что убийство доппельгангера заказал Филип Джеффрис, и отдает координаты. Доппельгангер заставляет Рэя надеть кольцо Чёрного Вигвама, а затем убивает, посылая того в Чёрный Вигвам, где Майк подбирает кольцо. Хатч и Шанталь едут через Юту .

Фрэнк сообщает Гордону о недавно найденных страницах дневника Лоры, в которых сообщается о двух Куперах. Альберт рассказывает Тэмми о первом деле «Голубой розы», где девушка была обвинена в убийстве своего точного близнеца. Узнав о кольце, найденном в желудке майора Бриггса, Дайана говорит, что у неё есть сводная сестра — Джейни-И. Гордон требует отделение ФБР в Лас-Вегасе искать Джонсов. Он вспоминает сон с Моникой Белуччи ( ) и последнее появление Филипа Джеффриса. Заместителя шерифа Чэда арестовывают за пособничество преступникам и сажают в камере, где его соседом становится странный парень, у которого изо рта постоянно течет кровь. Фрэнк, Ястреб, Бобби и Энди следуют указаниям майора Бриггса и находят в лесу обнаженную девушку с зашитыми глазами — Найдо. В вышине возникает вихрь и Энди переносит к Пожарному, который показывает ему образы событий в Нью-Мексико, Лору, двух Куперов, Люси и три вспышки электричества на столбе № 6 из фильма « Огонь, иди со мной ». Энди возвращается и переносит Найдо в офис шерифа, он выглядит очень серьёзным. Джеймс Хёрли разговаривает со своим коллегой — охранником Фредди ( ). Тот ведает Джеймсу историю обретения невиданной силы в правой руке: после видения с Пожарным он купил зелёную резиновую перчатку, получил силу, переехал из Лондона в Твин Пикс, а также он говорит, что когда пытался снять её, то из руки пошла кровь. Джеймс замечает странный гул в бойлерной.

Доппельгангер Купера прибывает в лавку-бензоколонку на встречу с Джеффрисом (тот появляется в виде металлического кожуха). Разговор выходит к некой Джуди, которую чёрный Купер уже встречал. Джеффрис даёт ему числа для поисков. Снаружи на доппельгангера нападает Ричард Хорн. Он обвиняет его в службе властям: у его матери — Одри была фотография доппельгангера в ФБРовском костюме. Чёрный Купер его усмиряет и белёт с собой. В Лас-Вегасе Шанталь убивает Дункана Тодда и его помощника Роджера ( ) прямо в офисе. Купер в доме Даги ест торт и смотрит фильм по телевизор. Он реагирует на имя Гордона, названного с экрана, направляется к розетке и засовывает туда десертную вилку; происходит короткое замыкание и Купер впадает в кому.

Доппельгангер Купера с Ричардом следуют по координатам. Джерри Хорн через бинокль видит, как доппельгангер посылает Ричарда к нужной точке, где того убивает током. Шанталь и Хатч караулят Даги у его дома, но нарываются на местного бухгалтера ( ), который их застреливает; всё это происходит на глазах у ФБР, которые тоже следят за домом Даги. Купер выходит из своего коматозного состояния (как после удара током, так и после Вигвама). Майк в видении сообщает ему, что доппельгангер на свободе и даёт ему кольцо, а Купер даёт ему прядь своих волос, прося «сделать ещё одного» из семени . Дэйл Купер чувствует себя отменно и просит братьев Митчамов организовать ему перелёт в Спокэн, штат Вашингтон. Получив сообщение от доппельгангера, Дайана рассказывает отряду Голубой розы о том, что Купер изнасиловал её в их последнюю встречу. Восклицая « Я в отделении шерифа... Я не я », она достаёт пистолет, но её убивают Альберт и Тэмми. В Красной комнате Майк говорит Дайане, что она была специально изготовлена, Дайана знает это и исчезает, превращаясь в семя. Таким образом, эта Дайана оказалась ещё одним доппельгангером.

Гордон Коул рассказывает Альберту о " Джоудэй ", злой сущности, известной позже как "Джуди", и о поисковом плане, который он составил вместе с Купером и Джеффрисом. Агент Хедли ( Джей Р. Фергюсон ) сообщает Коулу об исчезновении Даги. Босс Даги передает Коулу послание Купера о том, что он направляется в Твин Пикс. Чэд сбегает из своей камеры, но его обездвиживает Фредди. Чёрный Купер приезжает на место, в лес, куда указывает третья пара координат. Пожарник успевает переправить его к офису шерифа. Чёрный Купер идет к шерифу, на предложение чашки кофе — отказывается. Во время разговора Фрэнку звонит настоящий Купер,. Доппельгангер предпринимает попытку застрелить шерифа, но получает пулю от Люси, которую в дверях оставил Энди. Сам Энди выводит из камер Найдо, Фредди и Джеймса к остальным. Прибывают Купер, отряд "Голубая роза" и Митчамы. Чёрные бродяги/дровосеки высвобождают БОБа из живота доппельгангера, и тот начинает нападать на Купера. Вмешивается Фредди, Купер зная о его силе просит помочь. С трудом, но Фредди удается уничтожить БОБа. Купер надевает кольцо на палец доппельгангера, посылая того в Чёрный вигвам. Найдо превращается в Дайану ( Лора Дерн ), именно эта Дайана оказывается настоящей. Купер прощается со всеми.

В Черном Вигваме сгорает двойник Купера. Майк ( ) создает ещё одного Даги Джонса, который возвращается к своей жене Джейни-И ( Наоми Уоттс ) и сыну Сонни Джиму ( Пирс Ганьон ). Настоящий Купер ведет Лору через леса Твин Пикс, когда она внезапно с криком исчезает. Купер вновь появляется в Красной Комнате, встречая Майка и Эволюцию Руки (Дерево). Майк спрашивает: «Это будущее или прошлое?». Дерево спрашивает: «А это история о девочке, что живет в конце улицы. Это она?». Повзрослевшая Лора в Красной Комнате что-то шепчет на ухо Куперу и с криком исчезает. Купер в соседней комнате видит отца Лоры, который дрожащими губами говорит: "Найди Лору". Купер, в конце концов, покидает Черный Вигвам и оказывается в Роще Гластонбери, где встречает Дайану. Утром Купер и Дайана проезжают 430 миль в пустыню и останавливаются на обочине рядом с линией электропередач. Купер выходит из машины и загадочно произносит: "Это точно здесь". Дайана спрашивает Купера, хочет ли он по-прежнему выполнить то, что задумал? Купер в ответ предупреждает, что как только они пересекут некую черту в 430 миль, то «по ту сторону всё может измениться». Дайана целует Купера и командует: "Поехали!". Автомобиль пересекает 430-ю милю и продолжает движение в полной темноте ночи. Когда они добираются до мотеля, Купер регистрируется, а Дайана ненадолго видит другую версию себя. Той ночью Дайана и Купер занимаются сексом в номере мотеля, но Дайана явно чем-то расстроена. Утром Купер просыпается в другом номере мотеля и обнаруживает, что Дайаны нет. Он находит записку, написанную некой «Линдой», адресованную некоему «Ричарду», в которой говорится, что она ушла, и что их больше ничего не связывает. Купер едет в Одессу, штат Техас, и по дороге замечает "Кофейню Джуди". Там он профессионально останавливает трех ковбоев (Мэтт Батталья, Хит Хенсли и Роб Марс), пристающих к официантке Кристи ( Франческа Иствуд ). Купер спрашивает Кристи: "Здесь есть другая официантка?", и получает ответ: "Да, у нее выходной. Вернее, даже третий выходной". Кристи в испуге даёт ее адрес Куперу. Купер едет по указанному адресу, где ему открывает дверь некая Кэрри Пейдж ( Шерил Ли ), которая, несмотря на то, что Купер называет её Лорой и она выглядит как повзрослевшая Лора, всё же называет себя Кэрри Пейдж. Купер настаивает на том, что она Лора, и предлагает отвезти ее домой, в Твин Пикс. Кэрри, уже жаждущая покинуть Одессу, соглашается последовать за ним. Пока Кэрри собирает вещи, Купер осматривает ее дом и видит тело мужчины с огнестрельным ранением на диване, белую статуэтку лошади и штурмовую винтовку на полу. Считая, что это Лора, Купер везет её в дом Палмеров в Твин Пикс. Пока они едут, ночью Кэрри начинает вспоминать о своем прошлом в Одессе, о том, как она пыталась содержать дом в чистоте, несмотря на то, что не знала ничего лучшего. В полудрёме она произносит: "В то время я была слишком юной и глупой". В Твин Пикс они проезжают мимо закусочной "Double R Diner", прежде чем припарковаться перед Палмер-Хаусом. Кэрри ничего не узнает. Купер стучит в дверь, но им открывает незнакомка. Женщина называет себя Элис Тремонд ( ) и, поговорив со своим невидимым партнером, отвечает им, что они купили дом у миссис Чалфонт и что они не знают, кто был предыдущим владельцем или кто такая Сара Палмер. Купер благодарит ее и они с Кэрри, в недоумении, уходят. Купер колеблется и снова поворачивается к дому. Машинально идя, Купер спрашивает: «Какой сейчас год?», Кэрри оборачивается, чтобы посмотреть на дом, и слышит, как Сара Палмер ( Грейс Забриски ) зовет «Лору». Кэрри кричит, как Лора. В этот момент в доме гаснет весь свет и все, что отображается на экране, погружается во тьму.