Interested Article - Гаплогруппы

Гаплогруппа — группа схожих гаплотипов , имеющих общего предка, у которого произошла мутация , унаследованная всеми потомками (обычно — однонуклеотидный полиморфизм ). Термин «гаплогруппа» широко применяется в популяционной генетике и генетической генеалогии — науке, изучающей генетическую историю человечества с помощью исследования гаплогрупп Y-хромосомы (Y-ДНК), митохондриальной ДНК ( мтДНК ) и ГКГ-гаплогруппы . Генетические маркеры Y-ДНК передаются с Y-хромосомой исключительно по отцовской линии (то есть от отца сыновьям), а маркеры мтДНК — по материнской линии (от матери всем детям). Таким образом, мужчины являются носителями маркеров Y-ДНК и мтДНК, а женщины — только мтДНК. Гаплотипы по аутосомным маркерам представлены и у мужчин, и у женщин.

Популяционная генетика гаплогрупп

Y-хромосомные гаплогруппы мировой популяции в доколониальный период

Предположительно, естественный отбор не действует или действует очень слабо в отношении мутации, приведшей к образованию гаплогруппы и находимой в наши дни. Тогда кроме скорости мутаций, варьирующей от маркера к маркеру, основная причина изменения соотношения гаплотипов в популяции — это генетический дрейф , случайные флуктуации , вызванные количеством потомков соответствующего пола, которым был передан данный маркер. Это приводит к постепенному изменению пропорции данного маркера либо до 100 %, либо к его полному исчезновению из популяции. В большой популяции генетический дрейф распространённых аллелей очень мал, но в малой популяции, где скрещивание проходит между близкородственными особями, пропорция аллелей изменяется относительно быстро. Таким образом, наблюдаемая географическая разница в гаплогруппах вызвана эффектом бутылочного горлышка и/или эффектом основателя , за которыми последовали разделение популяции на отдельные группы или значительное увеличение числа особей. В более молодых популяциях обнаруживаются не все аллели, которые были в предыдущей популяции: генетический дрейф приводит к исчезновению некоторых аллелей из популяции. Стоимость определения гаплотипа ограничивает количество используемых образцов, поэтому достоверность выводов ограничивается возможной статистической ошибкой.

Классификация

В научном мире существует устоявшаяся классификация основных гаплогрупп, однако расположение, наименование и наличие субкладов часто вызывает споры. Так, для уточнения актуальной информации база обновляет дерево гаплогрупп ежеквартально .

Гаплогруппы Y-ДНК

Дерево гаплогрупп Y-ДНК выглядит следующим образом:

п о р Эволюционное древо
Y-хромосомный Адам
A0-T
A00 A0 A1
A1a
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1  F2  F3
G
H IJK
IJ K
I J K2
L (K1a) T (K1b) K2a/K2a1/ NO /NO1
N O P (K2b2) /P1
S (K2b1a) M (K2b1b) Q R


В 2002 году консорциум по Y-хромосоме (Y Chromosome Consortium) выработал общую классификацию и номенклатуру по линиям Y-хромосомы . Выделено 18 основных мутационных кластеров (клад), обозначаемых латинскими буквами от A до R. Порядок букв отражает последовательность возникновения мутаций. Эти клады в свою очередь разветвляются на гаплогруппы, которые нумеруются цифрами и буквами.

До 2002 года применялись более простые обозначения по номерам гаплогрупп: НG1, HG2 и т. д. Таблица позволяет перевести старые обозначения, используемые в научных статьях, в современную номенклатуру.

Устаревшие HG1 HG2 HG3 HG8 HG9 HG12 HG16 HG21
YCC R1b I R1a E3a J K N3 E3b

Гаплогруппы мтДНК

Модель миграции человечества на основе анализа митохондриальной ДНК

Митохондриальная Ева
|
L0 L3
|
M N
| |
D E G Q R A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 P I N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Устаревшие кластеры


См. также

Примечания

  1. . Дата обращения: 19 июня 2022. 15 июня 2022 года.

Ссылки

  • Степанов В. А., Харьков В. Н., Пузырев В. П. // Вестник ВОГиС, 2006, Том 10, № 1 57. ГУ НИИ медицинской генетики Томского научного центра Сибирского отделения РАМН, Томск, Россия
Источник —

Same as Гаплогруппы