Interested Article - Альфа-спираль

Вид сбоку альфа-спирали, созданной из остатков аланина , с атомарным разрешением. Водородные связи обозначены красно-фиолетовым цветом, расстояние между атомами водорода и кислорода 2,08 Å (208 пм ). Полипептидная цепочка направлена вверх, то есть её N-конец находится внизу, а C-конец — вверху. Боковые цепи аминокислот направлены несколько книзу, в направлении N-конца

Альфа-спираль (α-спираль) — элемент вторичной структуры белков , имеющий форму правозакрученной винтовой линии , в котором каждая аминогруппа (-NH) в каркасе образует водородную связь с карбонильной группой (-C=O) аминокислоты , находящейся на 4 аминокислоты раньше (водородная связь ). Этот элемент вторичной структуры иногда также называют классической альфа-спиралью Полинга — — по именам авторов, впервые описавших эту структуру в 1951 году .

Параметры идеальной α-спирали:

  • число аминокислотных остатков на виток спирали — 3,6—3,7;
  • диаметр спирали — 1,5 нм ;
  • шаг спирали — 0,54 нм;
  • на один аминокислотный остаток приходится 0,15 нм.

Такие параметры вычислены исходя из предположения, что конформация всех аминокислотных остатков (углы φ и ψ), входящих в состав α-спирали, одинакова. Однако в реальных белках конформации отдельных аминокислотных остатков немного различаются, что может приводить к небольшому искривлению оси спирали, к разному количеству аминокислотных остатков в витках спирали и т. п.

Примечания

  1. Pauling L., Corey R. B., Branson H. R. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1951. — Vol. 37 . — P. 205—211 . — doi : . — . 12 декабря 2017 года.
  2. Pauling L., Corey R. B. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1951. — Vol. 37 . — P. 235—240 . — . 13 марта 2018 года.

См. также

Литература

Источник —

Same as Альфа-спираль