Герцики
- 1 year ago
- 0
- 0
HslVU (HslUV, ClpYQ) — протеаза из группы АТФ-зависимых протеаз, присутствующая у многих бактерий , включая Escherichii coli и Bacillus subtilis . Состоит из двух компонентов, HslU (ClpY) — АТФ-зависимый шаперон и активатор протеолитической активности у HslV (ClpQ) — собственно протеазы. Активный комплекс состоит из двух колец из шести белковых субъединиц HslV, соединённых вместе, и по кольцу из шести белковых субъединиц HslU с каждой стороны. Кольца соединены вместе, образуя полый цилиндр, при этом кольца HslU находятся со внешней стороны. Как и у всех других АТФ-зависимых протеаз, активный сайт находится внутри цилиндра, и полипептидный субстрат должен быть развёрнут и активно перемещён внутрь для того, чтобы произошел протеолиз , , , .
HslU является шапероном , распознающим, разворачивающим и преносящим белки-субстраты внутрь полости протеазной части. HslU, является членом обширного семейства (ATPases Associated with diverse cellular Activities, АТФазы связанные с различными клеточными активностями) , . HslU — гомолог СlpX, АТФ-зависимого шаперона, компонента ClpXP протеазы . Благодаря этому, а также определённой схожести строения и функционирования, HslVU получил своё второе имя, также широко используемое — «ClpYQ». HslU состоит из трёх доменов: N-концевой домен, вставленный в него Промежуточный домен (англ. «Intermediate», I-домен) и С-концевой домен. В N-концевом домене находятся традиционные мотивы Walker A и Walker B, участвующие в связывании и расщеплении АТФ . Промежуточный домен ответственен за связывание и распознавание субстратов . С-концевой домен вместе с частью N-концевого домена участвует во взаимодействии с HslV . N-концевой домен содержит GYVG-мотив, необходимый для разворачивания субстрата и перенесения его в HslV .
В отличие от HslU, имеющего гомологию с ClpX, HslV не имеет гомологии с ClpP или какой-нибудь другой бактериальной протеазой. Вместо этого он имеет слабую гомологию с протеолитической субъединицей эукариотической протеосомы . Так же как и у протеосомы каталитическую роль выполняет N-концевой остаток треонина (хотя у B. subtilis N-концевой и каталитический остаток — серин ) . Таким образом HslV принадлежит к группе N-концевых протеаз . HslV является . Сам по себе HslV слабо активен. Необходимо взаимодействие с HslU, чтобы активировать протеазный компонент .
HslVU не представлен так широко в различных группах бактерий, как другие АТФ-зависимые протеазы, такие как ClpP , Lon , FtsH. Тем не менее HslVU присутствует у α- , γ- и , фирмикут , спирохет и таких древних групп как Aquifex и . Кроме того, он присутствует в митохондриях таких групп низших эукариот как Trypanosoma , Leishmania , Plasmodium , Amoebozoa , Chromalveolata , Rhizaria , Excavata , а также некоторых растений .
У E. coli субстратная специфичность HslVU во многом пересекается со специфичностью Lon . Также как и Lon , HslVU распознаёт и разрушает неправильно свёрнутые или аггрегированные белки, особенно при тепловом шоке . Два классических субстрата Lon — ингибитор клеточного деления SulA и регулятора синтеза бактериальной капсулы RcsA, являются также субстратами для HslVU , . HslVU также способен разрушать белки с SsrA-хвостом . Ещё одним субстратом для HslVU является — , отвечающий за транскрипцию белков теплового шока .
HslU и HslV находятся друг за другом в одном опероне . Экспрессия этого оперона индуцируется при тепловом шоке, что повышает в несколько раз уровень этой протеазы в клетке . При этом HslVU участвует в разрушении аггрегированных и денатурированных теплом белков. Как большинство других белков теплового шока , оперон индуцируется — теплового шока .