Interested Article - MiR-16

MiR-16 — это cемейство предшественников микроРНК, представляет собой группу родственных небольших некодирующих генов РНК, которые регулируют экспрессию генов . miR-16, miR-15, mir-195 и miR-497 являются родственными последовательностями-предшественниками микроРНК из семейства генов mir-15 . Это семейство микроРНК, по-видимому, специфично для позвоночных, и его члены были предсказаны или экспериментально подтверждены для широкого круга видов позвоночных .

История изучения

Человеческий предшественник miR-16 был обнаружен Калином и его коллегами с помощью подробного профиля экспрессии и анализа кариотипа пациентов . Кариотипирование хромосомных структур у людей с B-клеточной хронической лимфоцитарной лейкемией (B-CLL) показало, что более чем у половины есть изменения в области 13q14. Делеции этой хорошо охарактеризованной 1 мегабазной области генома также наблюдались примерно в 50 % лимфом из мантийных клеток , до 40 % множественной миеломы , и 60 % случаев рака простаты . Всесторонний скрининг региона в то время не предоставил убедительных доказательств участия какого-либо из известных на то время генов. Используя CD5 + B-лимфоциты которые, как известно, накапливаются с прогрессированием B-CLL , минимальная область, потерянная из области 13q14, была тщательно исследована на предмет регуляторных элементов . Общедоступные базы данных последовательностей были использованы для идентификации кластера гена, который кодирует гомолог к человеку miR15 и miR16 от Элеганса Caenorhabditis .

Генные мишени

В оригинальной публикации, которая идентифицировала действие miR15 и miR16 в развитии B-CLL , Calin и др. Предположили, что miR16 может быть мишенью с несовершенным спариванием оснований для 14 генов . Увеличение количества CD5 + B-лимфоцитов при ХЛЛ предполагает, что miR16 может участвовать в клеточной дифференцировке . В моделях на животных одноцепочечные виды микроРНК действуют путем связывания с несовершенными комплементами мРНК , обычно с 3 'UTR , хотя мишени также наблюдались в кодирующей последовательности мРНК . Подавление miR16 (а также miR15 ) наблюдали в . miR16, как было показано, связывается с парой из девяти оснований с комплементарной последовательностью в 3'-UTR области BCL2 , которая является антиапоптотическим геном, участвующим в эволюционно консервативном пути запрограммированной гибели клеток . Было показано, что в линии клеток карциномы носоглотки miR-16 нацелен на 3'-UTR фактора роста эндотелия сосудов (VEGF) и подавляет экспрессию VEGF, который является важным ангиогенным фактором.

Клиническая значимость

Изменённая экспрессия микроРНК-16 наблюдалась при раке включая злокачественные новообразования груди , толстой кишки , мозга , легких , лимфатической системы , яичников , поджелудочной железы , простаты и желудка . Эта разница в уровнях экспрессии может использоваться для различения злокачественных и здоровых тканей и для определения клинического прогноза . Тот факт, что патология связана с другим профилем экспрессии , привел к предположению, что специфические биомаркеры заболевания могут служить потенциальными мишенями для направленного клинического вмешательства. Совсем недавно появились доказательства того, что при колоректальном раке эффективность лечения моноклональным антителом цетуксимабом можно оценить по типу экспрессии колоректальной карциномы после терапии .

miR-16 и miR-15a сгруппированы в области 0,5 т.п.н. в хромосоме 13 (13q14) у человека, хромосомной области, которая, как было показано, удалена или подавлена примерно в более чем половине B-CLL , наиболее распространенной. форма лейкемии у взрослых. Канцерогенез — это постепенный процесс, включающий множество генетических мутаций , поэтому у каждого пациента со злокачественными новообразованиями присутствует гетерогенная популяция клеток . Тот факт, что потеря микро РНК mir-16 наблюдается в большой части клеток, указывает на изменение, произошедшее на ранней стадии развития и на цель терапевтического вмешательства.

Примечания

  1. . Дата обращения: 7 июля 2021. 9 июля 2021 года.
  2. . Дата обращения: 7 июля 2021. 23 декабря 2012 года.
  3. "Frequent deletions and down-regulation of micro-RNA genes miR15 and miR16 at 13q14 in chronic lymphocytic leukemia". Proc Natl Acad Sci USA . 99 (24): 15524—15529. 2002. doi : . PMID .
  4. "Genetic alterations in chronic lymphocytic leukaemia". Clin Transl Oncol . 11 (4): 194—198. 2009. doi : . PMID .
  5. Bullrich F, Fujii H, Calin G, Mabuchi H, Negrini M, Pekarsky Y, Rassenti L, Alder H, Reed JC, Keating MJ, Kipps TJ, Croce C, M. (2001). . Cancer Res . 61 (18): 6640—6648. PMID . из оригинала 14 августа 2016 . Дата обращения: 7 июля 2021 . {{ cite journal }} : Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) ( ссылка )
  6. "Nucleotide sequence, transcription map, and mutation analysis of the 13q14 chromosomal region deleted in B-cell chronic lymphocytic leukemia". Blood . 97 (7): 2098—2104. 2001. doi : . PMID .
  7. "Loss of heterozygosity at 13q14 and 13q21 in high grade, high stage prostate cancer". Prostate . 49 (3): 166—171. 2001. doi : . PMID .
  8. "Cloning of two candidate tumor suppressor genes within a 10 kb region on chromosome 13q14, frequently deleted in chronic lymphocytic leukemia". Oncogene . 15 (20): 2463—2473. 1997. doi : . PMID .
  9. . Cancer Res . 61 (7): 2870—2877. 2001. PMID . из оригинала 14 августа 2016 . Дата обращения: 7 июля 2021 .
  10. "Comprehensive analysis of a large genomic sequence at the putative B-cell chronic lymphocytic leukaemia (B-CLL) tumour suppresser gene locus". Mutat Res . 458 (3—4): 55—70. 2001. doi : . PMID .
  11. "B-cell neoplasia associated gene with multiple splicing (BCMS): the candidate B-CLL gene on 13q14 comprises more than 560 kb covering all critical regions". Hum Mol Genet . 10 (12): 1275—1285. 2001. doi : . PMID .
  12. "Deletion analysis of chromosome 13q14.3 and characterisation of an alternative splice form of LEU1 in B cell chronic lymphocytic leukemia". Leukemia . 16 (17): 1267—1275. 2002. doi : . PMID .
  13. . J Clin Oncol . 17 (1): 399—408. 1999. doi : . PMID .
  14. "Identification of novel genes coding for small expressed RNAs". Science . 294 (5543): 853—858. 2001. doi : . PMID .
  15. "An abundant class of tiny RNAs with probable regulatory roles in Caenorhabditis elegans". Science . 294 (5543): 858—862. 2001. doi : . PMID .
  16. "An extensive class of small RNAs in Caenorhabditis elegans". Science . 294 (5543): 862—864. 2001. doi : . PMID .
  17. "Conserved seed pairing, often flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are microRNA targets". Cell . 120 (1): 15—20. 2005. doi : . PMID .
  18. "Systematic discovery of regulatory motifs in human promoters and 3' UTRs by comparison of several mammals". Nature . 434 (7031): 338—345. 2005. doi : . PMID .
  19. "MicroRNAs to Nanog, Oct4 and Sox2 coding regions modulate embryonic stem cell differentiation". Nature . 455 (7216): 1124—1128. 2008. doi : . PMID .
  20. "Accumulation of miR-155 and BIC RNA in human B-cell lymphoma". Proc Natl Acad Sci U S A . 102 (10): 3627—3632. 2004. doi : . PMID .
  21. "miR-15 and miR-16 induce apoptosis by targeting BCL2". Proc Natl Acad Sci U S A . 102 (39): 13944—13949. 2005. doi : . PMID .
  22. "MiRNA-directed regulation of VEGF and other angiogenic factors under hypoxia". PLOS One . 1 (1): e116. 27 December 2006. doi : . PMID . {{ cite journal }} : Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) ( ссылка )
  23. "The effect of central loops in miRNA:MRE duplexes on the efficiency of miRNA-mediated gene regulation". PLOS One . 3 (3): e1719. 5 March 2008. doi : . PMID . {{ cite journal }} : Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) ( ссылка )
  24. "MicroRNA expression profiles classify human cancers". Nature . 435 (7043): 834—838. 2005. doi : . PMID .
  25. Croce CM. (2009). "Causes and consequences of microRNA dysregulation in cancer". Nat Rev Genet . 10 (10): 704—714. doi : . PMID .
  26. "Human microRNA genes are frequently located at fragile sites and genomic regions involved in cancers". Proc Natl Acad Sci U S A . 101 (9): 2999—3004. 2004. doi : . PMID .
  27. "Downregulation of the tumor-suppressor miR-16 via progestin-mediated oncogenic signaling contributes to breast cancer development". Breast Cancer Res . 14 (3): R77. 2012. doi : . PMID . {{ cite journal }} : Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) ( ссылка )
  28. . Mol Cancer Res . 1 (12): 882—891. 2003. PMID . из оригинала 12 июля 2021 . Дата обращения: 7 июля 2021 .
  29. "MicroRNA expression profiles associated with prognosis and therapeutic outcome in colon adenocarcinoma". JAMA . 299 (4): 425—436. 2008. doi : . PMID .
  30. "Extensive modulation of a set of microRNAs in primary glioblastoma". Biochem Biophys Res Commun . 334 (4): 1351—1358. 2005. doi : . PMID .
  31. . Cancer Res . 65 (14): 6029—6033. 2007. doi : . PMID . из оригинала 26 марта 2015 . Дата обращения: 7 июля 2021 .
  32. . Cancer Res . 64 (11): 3753—3756. 2004. doi : . PMID . из оригинала 9 июля 2014 . Дата обращения: 7 июля 2021 .
  33. "High expression of precursor microRNA-155/BIC RNA in children with Burkitt's lymphoma". Genes Chromosomes Cancer . 39 (2): 167—169. 2004. doi : . PMID .
  34. . Cancer Res . 64 (9): 3087—3095. 2004. doi : . PMID . из оригинала 14 апреля 2016 . Дата обращения: 7 июля 2021 .
  35. . Cancer Res . 67 (8): 8699—8707. 2007. doi : . PMID . из оригинала 14 августа 2016 . Дата обращения: 7 июля 2021 .
  36. "MicroRNA expression patterns to differentiate pancreatic adenocarcinoma from normal pancreas and chronic pancreatitis". JAMA . 297 (17): 1901—1908. 2007. doi : . PMID .
  37. "The miR-15a-miR-16-1 cluster controls prostate cancer by targeting multiple oncogenic activities". Nat Med . 14 (11): 1271—1277. 2008. doi : . PMID .
  38. "MicroRNA signatures in human ovarian cancer". Cancer Cell . 13 (3): 272—286. 2008. doi : . PMID .
  39. "Unique microRNA molecular profiles in lung cancer diagnosis and prognosis". Cancer Cell . 9 (3): 189—198. 2006. doi : . PMID .
  40. "A MicroRNA signature associated with prognosis and progression in chronic lymphocytic leukemia". N Engl J Med . 353 (17): 1793—1801. 2005. doi : . PMID .
  41. Cho WC. (2010). "A MicroRNA signature associated with prognosis and progression in chronic lymphocytic leukemia". Expert Opin Ther Targets . 14 (10): 1005—1008. doi : . PMID .
  42. . Mol Cancer Ther . 14 (10): 1005—1008. 2010. doi : . PMID . из оригинала 25 октября 2018 . Дата обращения: 7 июля 2021 .
  43. Döhner H (2000). "Genomic Aberrations and Survival in Chronic Lymphocytic Leukemia". N Engl J Med . 343 (26): 1910—1916. doi : . PMID .
Источник —

Same as MiR-16