Interested Article - Целлюлозо-синтаза (УДФ-глюкозу-использующая)

В энзимологии , целлюлозо-синтаза ( Шифр КФ , УДФ -глюкоза:(1→4)-β- д -глюкан 4-β- д -гликозилтрансфераза ) - фермент , который катализирует химическую реакцию :

+ [(1→4)-β-D-глюкопиранозил] n = УДФ + [(1→4)-β-D-глюкопиранозил] n+1

Таким образом, субстратами этого фермента являются УДФ-глюкоза и [(1→4)-β-D-глюкопиранозил] n , а продуктами - УДФ и [(1→4)-β- D -глюкопиранозил] n+1 .

Фермент участвует в синтезе целлюлозы . Близкий фермент, использующий в качестве субстрата ГДФ-глюкозу - целлюлозо-синтаза (ГДФ-глюкозо-зависимая) (ЕС 2.4.1.29).

Целлюлоза

Целлюлозные фибриллы представляют собой совокупность неразветвленных полимерных цепей из β-(1→4)-связанных остатков глюкозы. Целлюлоза составляет значительную часть первичной и вторичной клеточной стенки у зеленых растений . Хотя этот фермент принципиально важен для построения клеточной оболочки наземных растений , он также имеется у водорослей , некоторых бактерий и ряда животных . В мире производится 2 × 10 11 тонн целлюлозных микрофибрилл. Целлюлоза являются основой для производства возобновляемого биотоплива и других материалов растительного происхождения (пиломатериалов, различных видов топлива, растительных кормов, бумаги и хлопковых и других волокон ).

Функции целлюлозы

Микрофибриллы синтезируются на поверхности клеточных мембран для усиления клеточных стенок, что было обширно исследовано биохимиками растений и клеточными биологами поскольку 1) они регулируют клеточный морфогенез и 2) они осуществляют в клеточной стенке вместе со многими другими компонентами (например, лигнином , гемицеллюлозой , пектиновыми веществами ) существенную поддержку ее структуры и формы клетки. Без этих вспомогательных структур, рост клеток бы вынудил их раздаваться во всех направлениях, тем самым теряя свою форму

Структура целлюлозо-синтазы

Растительная целлюлозо-синтазы принадлежат к семейству гликозилтрансфераз , которые являются белками, участвующими в биосинтезе и гидролизе большей части биомассы Земли. Целлюлоза синтезируется с помощью больших целлюлозо-синтазных комплексов (ЦОКов), которые состоят из изоформ синтазы (CesA), объединенных в уникальную гексагональную структуру, известную как “розеточный комплекс”, шириной 50 нм и высотой 30-35 нм. Насчитывается более 20 таких длинных интегральных мембранных белков , размер каждого составляет около 1000 аминокислот . Эти розеточные комплексы, которые ранее называли гранулами, были впервые обнаружены в 1972 году с помощью электронной микроскопии в видах зеленых водорослей Кладофора и Хетоморфа (Робинсон с соавт. 1972). Метод рентеноструктурного анализа показал, что CesAs располагаются на поверхности растительной клетки и являются вытянутыми мономерами с двумя каталитическими доменами , которые соединяются в димеры . Центральная часть димеров является каталитически активным центром. Поскольку целлюлоза синтезируется во всех клеточных стенках, апартаментов CesA белки присутствуют во всех тканях и типах клеток растений. Тем не менее, существуют различные типы CesA, и разные типы тканей могут отличаться по соотношению их концентраций. Например, белок AtCesA1 (RSW1) участвует в биосинтезе первичных клеточных стенок во всем растении, белок AtCesA7 (IRX3) экспрессируется только в стебле для синтеза вторичной клеточной стенки.

Активность целлюлозо-синтазы

Биосинтез целлюлозы-это процесс, в котором отдельные однородные β-(1→4)-глюкановые цепочки, длиной от 2000 до 25 000 остатков глюкозы, синтезируются и затем сразу образуют между собой водородные связи, формируя твердые кристаллические образования - микрофибриллы. Микрофибриллы в первичной клеточной стенки в длину составляют примерно 36 цепей, в то время как микрофибриллы вторичной клеточной стенки намного больше и содержащих до 1200 β-(1→4)-глюкановых цепей. УДФ-глюкоза, которая синтезируется с помощью фермента сахарозосинтазы, которая производит и транспортирует УДФ-глюкозу к плазматической мембране - это субстратЮ который использует целлюлозо-синтаза для построения глюкановой цепи. Скорость, с которой синтезируются остатки глюкозы для одной глюкановой цепи колеблется от 300 до 1000 остатков глюкозы в минуту, более высокая скорость чаще встречается во вторичных клеточных стенках, например в ксилеме.

Реакция с использованием УДФ-глюкозы

В энзимологии , целлюлозо-синтаза (УДФ-глюкозу-использующая) ( Шифр КФ ) является ферментом , который катализирует химическую реакцию

УДФ-глюкоза + [(1→4)-β- D -глюкопиранозил] n УДф + [(1→4)-β-D-глюкопиранозил] n+1

Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются УДФ-глюкоза и цепь (1→4)-β-D-глюкопиранозильных остатков, в то время как двумя его продуктами являются УДФ и удлиненная цепь глюкопиранозильных остатков. Глюкопиранозил - это пиранозная форма глюкозы , цепь (1→4)-β- D -глюкопиранозильных остатков - это целлюлоза , и, следовательно, ферменты этого класса играют важную роль в синтезе целлюлозы.

Этот фермент принадлежит к семейству гексозилтрансфераз, точнее - к гликозилтрансферазам . Систематическое название этого класса ферментов - УДФ-глюкоза: 1,4-β- D -глюкан 4-β- D -глюкозилтрансфераза. Другие общеупотребительные названия: УДФ-глюкоза-β-глюкан глюкозилтрансфераза , УДФ-глюкоза-целлюлоза глюкозилтрансфераза , GS-I , β-(1→4)-глюкозилтрансфераза , уридин дифосфоглюкоза-(1→4)-β-глюкан глюкозилтрансфераза , β-(1→4)-глюкан-синтаза , β-(1→4)-глюкан-синтетаза , β-глюкан синтаза , (1→4)-β- D -глюкан-синтаза , (1→4)-β-глюкан-синтаза , глюкан синтаза , УДФ-глюкоза-(1→4)-β-глюкан глюкозилтрансфераза , и уридин дифосфоглюкоза-целлюлоза глюкозилтрансфераза .

Поддерживающие структуры

Синтез микрофибрилл направляется кортикальными микротрубочками , лежащими под плазматической мембраной удлиняющихся клеток, которые образуют площадку, на которой ЦОК может преобразовать глюкозу в кристаллоподобные цепи. Гипотеза расположения микротрубочек и микрофибрилл на одной линии предполагает, что кортикальные микротрубочки, лежащие под плазматической мембраной удлиняющихся клеток, предоставляют пути для ЦОКов, которые преобразуют глюкозу молекул в кристаллоподобные микрофибриллы целлюлозы. "Прямая" гипотеза предполагает, что существуют некоторые типы прямых связей между комплексами CesA и микротрубочками. Кроме того, белок КОРРИГАН (KOR1) считается важнейшей составляющей синтеза целлюлозы, так как он воздействует на целлюлозу между плазматической мембраной и клеточной стенкой. KOR1 взаимодействует с двумя специфическими CesA-белками, возможно, корректируя и снимая напряжение, возникающее из-за синтеза глюкановой цепи, тем, что он гидролизует неупорядоченную аморфную целлюлозу.

Влияние окружающей среды

На активность целлюлозо-синтазы оказывают влияние многие экологические факторы, такие как гормоны, света, механические раздражители, питание и взаимодействия с цитоскелетом . Взаимодействие этих факторов может влиять на откладывание целлюлозы тем, что меняется количество образованного субстрата и концентрация и/или активность ЦОК в плазматической мембране.

Ссылки

  1. Cutler, S. Classification of nucleotide-diphospho-sugar glycosyltransferases based on amino acid sequence similarities (англ.) // Biochemistry : journal. — 1997. — Vol. 326 . — P. 929—939 . — doi : . — . — PMC .
  2. Olek, Rayon, Wakowski, Kim, Badger, Ghosh, Crowley, Himmel, Bolin, Carpita, A.T., C., L. H.R., P., J., L.N., S., D., M., M.E., N.C. (англ.) // The Plant Cell : journal. — 2014. — Vol. 26 . — P. 2996—3009 . — doi : . 1 декабря 2017 года. CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  3. Richmond, Todd. (англ.) // (англ.) . — 2000. — Vol. 1 . — P. 3001 . — doi : . 2 мая 2008 года.
  4. Lei, Li, Gu, L., S., Y. (англ.) // Frontiers of Plant Science : journal. — 2012. — Vol. 3 . — P. 75 . — doi : . 17 декабря 2014 года. CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  5. Nakashima, Yamada, Satou, Azuma, Satoh, K., L., Y., J., N. The evolutionary origin of animal cellulose synthase (англ.) // Development Genes and Evolution : journal. — 2004. — Vol. 214 . — P. 81—88 . — doi : . — . CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  6. Yin, Huang, Xu, Y., J., Y. The cellulose synthase superfamily in fully sequenced plants and algae (англ.) // BMC Plant Biology : journal. — 2009. — Vol. 9 . — P. 99 . — doi : . — . — PMC . CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  7. Sethaphong, Haigler, Kubicki, Zimmer, Bonetta, DeBolt, Yinling, L., C.H., J.D., J., D S., I.G. Tertiary model of a plant cellulose synthase (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2013. — Vol. 110 . — P. 7512—7517 . — doi : . — . — PMC . CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  8. Li, Lei, Gu, S., L., Y. (англ.) // Plant Signaling and Behavior : journal. — 2012. — Vol. 8 . — P. 23179 . 18 декабря 2014 года. CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  9. Lieth, H. (англ.) . — New York: Springer, 1975. — P. 119—129. 29 июня 2017 года.
  10. Cutler, Somerville, S., C. (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press , 1997. — Vol. 7 . — P. 108—111 . — doi : . 1 декабря 2017 года.
  11. Hogetsu, Shibaoka, T., H. Effects of colchicine on cell shape and on microfibril arrangement in the cell wall of Closterium acerosum (англ.) // Planta : journal. — 1978. — Vol. 140 . — P. 445—449 . — doi : . — .
  12. Campell, Davies, Bulone, Henrissat, J.A., G.J., V., B.A. . Classification of nucleotide-diphospho-sugar glycosyltransferases based on amino acid sequence similarities (англ.) // (англ.) : journal. — 1997. — Vol. 329 . — P. 719 . — . — PMC . CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  13. Giddings, Brower, Staehelin, T.H., D.L., L.A. formation of cellulose fibrils in primary and secondary walls (англ.) // Journal of Cellular Biology : journal. — 1980. — Vol. 84 . — P. 327—339 . — doi : . CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  14. Bowling, Brown, A.J., RM Jr. The cytoplasmic domain of the cellulose-synthesizing complex in vascular plants (англ.) // Protoplasma : journal. — 2008. — Vol. 233 . — P. 115—127 . — doi : .
  15. Robinson, White, Preston, D.G., R.K., R.D. (англ.) // Planta : journal. — 1972. — Vol. 107 . — P. 7512—7517 . — doi : . — . 13 июня 2018 года. CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  16. Richmond, T. Higher plant cellulose synthase (англ.) // (англ.) . — 2000. — Vol. 7 . — P. 3001 . — doi : .
  17. Heath, I.B. (англ.) // (англ.) : journal. — 1974. — Vol. 48 . — P. 445—449 . — doi : . 17 декабря 2014 года.
  18. Paredez, Somerville, Ehrhardt, A.R., C.R., D.W. (англ.) // Science : journal. — 2006. — Vol. 312 . — P. 1491—1495 . — doi : . — . 24 сентября 2015 года. CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
  19. Wightman, Turner, R., S.R. The roles of the cytoskeleton during cellulose deposition at the secondary cell wall (англ.) // (англ.) : journal. — 2008. — Vol. 54 . — P. 794—805 . — doi : . — .
  20. Green, P.B. (англ.) // Science. — 1962. — Vol. 138 . — P. 1404—1405 . — doi : . 24 сентября 2015 года.
  21. Mansoori, Timmers, Desprez, Kamei, Dees, Vinken, Viiser, Hoefte, Venhettes, Trindade, N., J., T., CLA, DCT, J.P., RGF, H., S., L.M. (англ.) // PLoS ONE : journal. — 2014. — Vol. 9 . — P. e112387 . — doi : . 17 декабря 2014 года. CS1 maint: Multiple names: authors list ( )
Источник —

Same as Целлюлозо-синтаза (УДФ-глюкозу-использующая)