Interested Article - Цистеиновые протеазы

ayesha
  • 2021-11-19
  • 1

Цистеиновые протеазы , также известные, как цистеиновые эндопептидазы или тиоловые протеазы ( КФ 3.4.22) — группа протеолитических ферментов ( эндопептидаз ), расщепляющих белковые молекулы, на составляющие их аминокислоты , посредством гидролиза пептидной связи ( протеолиза ). В состав активного центра данных протеаз обязательно входит цистеин и их каталитическая активность зависит от сульфгидрильной или (-SH-группа).

Цистеиновые протеазы обычно встречаются во фруктах , включая папайю , ананас , инжир и киви . Доля протеазы во фруктах зависит от зрелости, чем больше зрелость, тем меньше их содержится в плоде. Известно, что десятки латексов из различных семейств растений содержат цистеиновые протеазы . Тиоловые протеазы используются в качестве основного компонента в мясных тендерайзерах (размягчителях).

Классификация

Система классификации протеаз MEROPS насчитывает 14 суперсемейств плюс несколько необозначенных семейств (с 2013 года), каждая из которых содержит большое количество семейств. Каждое надсемейство использует каталитическую триаду или диаду в разных белковых фолдах, и, таким образом, представляют собой конвергентную эволюцию каталитического механизма.

Для суперсемейств, P = суперсемейство, которое состоит из смесь семейств класса нуклеофилов, C = суперсемейство чисто цистеиновых протеаз. Внутри каждого суперсемейства, входящие в них семейства обозначаются каталитическим нуклеофилом (C = цистеинпротеазы).

В таблице указаны все суперсемейства цистеиновых протеаз:

Суперсемейство Семейство Примеры
CA C1, C2, C6, C10, C12, C16, C19, C28, C31, C32, C33, C39, C47, C51, C54, C58, C64,

C65, C66, C67, C70, C71, C76, C78, C83, C85, C86, C87, C93, C96, C98, C101

Папаин ( Carica papaya ) , бромелаин ( Ananas comosus ), ( печёночники ) и ( Homo sapiens )
CD C11, C13, C14, C25, C50, C80, C84 Каспаза 1 ( Rattus norvegicus ) и сепараза ( Saccharomyces cerevisiae )
CE C5, C48, C55, C57, C63, C79 ( аденовирус человека тип 2)
CF C15 ( )
CL C60, C82 ( Staphylococcus aureus )
CM C18 Пептидаза-2 вируса гепатита C ( вирус гепатита C )
CN C9 ( )
CO C40 ( )
CP C97 ( Mus musculus )
PA C3, C4, C24, C30, C37, C62, C74, C99 TEV-протеазы ( )
PB C44, C45, C59, C69, C89, C95 Предшественник амидофосфорибозилтрансферазы ( Homo sapiens )
PC C26, C56 ( Rattus norvegicus )
PD C46 ( Drosophila melanogaster )
PE P1 ( )
Необозначенные C7, C8, C21, C23, C27, C36, C42, C53, C75

Механизм катализа

Реакционный механизм, опосредованный цистеиновой протеазой путём расщепления пептидной связи .

Первым шагом в механизме реакции, посредством которого цистеиновые протеазы катализируют гидролиз пептидных связей, является депротонизация тиола в активном центре фермента смежной аминокислотой с основной боковой цепью, обычно гистидиновым остатком. Следующим шагом является нуклеофильная атака анионной серы депротонированного цистеина на карбонильном атоме углерода основания. На этой стадии фрагмент субстрата высвобождается с аминовым концом, остаток гистидина в протеазе восстанавливается до депротонированной формы и образуется тиоэфирное промежуточное соединение, связывающее новый карбокси-конец субстрата с цистеиновым тиолом. Поэтому их также иногда называют тиол-протеазами. Затем тиоэфирную связь гидролизуют с образованием фрагмента карбоновой кислоты на оставшемся фрагменте субстрата при регенерации свободного фермента.

Регуляция

Протеазы обычно синтезируются в виде больших белков-предшественников, называемых зимогенами, примером служат предшественники сериновых протеаз трипсиноген и химотрипсиноген и пепсиноген, предшественник аспарагиновой протеазы. Протеаза активируется удалением ингибирующего сегмента или белка. Активация происходит, когда протеаза доставляется в конкретный внутриклеточный компартмент (например, в лизосому ) или во внеклеточную среду (например, в просвет желудка). Данная система предотвращает повреждения клеток, которые продуцируют протеазу.

Ингибиторы протеаз обычно представляют собой белки с доменами, которые интернируют или блокируют активный сайт протеазы для предотвращения доступа к субстрату. При конкурентном ингибировании ингибитор связывается с активным центром, тем самым предотвращая взаимодействие фермента с субстратом. При неконкурентном ингибировании ингибитор связывается с аллостерическим сайтом, который изменяет конформацию активного сайта и, тем самым делает его недоступным для субстрата.

Примеры ингибиторов протеаз:

Биологическая значимость

Цистеиновые протеазы играют многогранную роль, практически во всех аспектах физиологии и развития. В растениях они важны для роста и развития, а также для накопления и мобилизации белков хранения, таких как семена. Кроме того, они участвуют в сигнальных путях и в ответ на биотические и абиотические стрессы . У людей и других животных они ответственны за старение и апоптоз (запрограммированную гибель клеток), иммунные ответы белков MHC класса II , прогормональный процессинг и ремоделирование внеклеточного матрикса , важные для развития костей. Способность макрофагов и других клеток мобилизовывать эластолитические цистеиновые протеазы на их поверхности в специализированных условиях может также приводить к ускоренной деградации коллагена и эластина в местах воспаления при таких заболеваниях, как атеросклероз и эмфизема . Несколько вирусов (например, полиомиелита , гепатита С ) экспрессируют весь свой геном в виде простого массивного полипептида и используют протеазу для расщепления его на функциональные единицы (например, протеазу ).

Применение

В качестве потенциальных фармацевтических препаратов

В настоящее время широко распространено использование цистеиновых протеаз в качестве одобренных и эффективных противогельминтных препаратов. Было обнаружено, что цистеиновые протеазы растений, выделенные из них, обладают высокой протеолитической активностью, которые, как известно, расщепляют (гидролизуют) кутикулу нематод и обладает очень низкой токсичностью . Сообщалось об успешных результатах использования цистеиновых протеаз против нематод , таких как Heligmosomoides bakeri , , Nippostrongylus brasiliensis , Trichuris muris и Ancylostoma ceylanicum ; цепней — Rodentolepis microstoma , а также свиного скребня — паразита Macracanthorynchus hirundinaceus . Полезным свойством цистеиновых протеаз является устойчивость к кислой среде желудка, что позволяет осуществлять их пероральное введение. Они представляют собой альтернативный механизм действия современным антигельминтикам, и развитие резистентности считается маловероятным, поскольку это потребует полного изменения структуры кутикулы гельминта.

Другое

Цистеиновые протеазы используются в качестве кормовых добавок для скота в качестве улучшителей усваиваемости белков и нуклеиновых кислот .

Примечания

  1. Domsalla A. , Melzig M. F. (англ.) // Planta medica. — 2008. — Vol. 74, no. 7 . — P. 699—711. — doi : . — . [ ]
  2. Mitchel R. E. , Chaiken I. M. , Smith E. L. (англ.) // The Journal of biological chemistry. — 1970. — Vol. 245, no. 14 . — P. 3485—3492. — . [ ]
  3. Sierocka I. , Kozlowski L. P. , Bujnicki J. M. , Jarmolowski A. , Szweykowska-Kulinska Z. (англ.) // BMC plant biology. — 2014. — Vol. 14. — P. 168. — doi : . — . [ ]
  4. Sorimachi H. , Ohmi S. , Emori Y. , Kawasaki H. , Saido T. C. , Ohno S. , Minami Y. , Suzuki K. (англ.) // Biological chemistry Hoppe-Seyler. — 1990. — Vol. 371 Suppl. — P. 171—176. — . [ ]
  5. Grudkowska M., Zagdańska B. (неопр.) // Acta Biochim. Pol.. — 2004. — Т. 51 , № 3 . — С. 609—624 . — . 24 октября 2018 года.
  6. Chapman H.A., Riese R.J., Shi G.P. Emerging roles for cysteine proteases in human biology (англ.) // Annual Reviews : journal. — 1997. — Vol. 59 . — P. 63—88 . — doi : . — .
  7. Stepek G., Behnke J.M., Buttle D.J., Duce I.R. Natural plant cysteine proteinases as anthelmintics? (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2004. — July ( vol. 20 , no. 7 ). — P. 322—327 . — doi : . — .
  8. Behnke J.M., Buttle D.J., Stepek G., Lowe A., Duce I.R. Developing novel anthelmintics from plant cysteine proteinases (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2008. — Vol. 1 , no. 1 . — P. 29 . — doi : . — . — PMC .
  9. O'Keefe, Terrence . Wattagnet (6 апреля 2012). Дата обращения: 6 января 2018. 23 сентября 2018 года.
Источник —

ayesha
  • 2021-11-19
  • 1
  • Tags:

Same as Цистеиновые протеазы

The title for the last searches